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CD測定での融解測定 トピック削除
No.7620-TOPIC - 2019/01/29 (火) 17:06:53 - 凡人a
見ていただいた方ありがとうございます。私は修士2年で生化学系の研究室に所属しています。私の実験では、タンパク質の変異体を大腸菌に発現させ、温度を上げながら222nmのCDを測定することで変異ごとの融解温度を出しているのですが、ほとんど全ての変異体ではシグモイド様(S字)の融解曲線を得ているのですが、ある変異体だけ逆S字になる変異体があり、その意味がわかりません。全ての変異体は測定前に190-300nmのスペクトルを測定していてほとんど同じ構造だと考えています。縦軸はCDです。拙い文章申し訳ございませんがどなたか分かる方よろしくお願いいたします。
 
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No.7620-5 - 2019/02/02 (土) 01:56:09 - _1
とりあえず、222nmだけでなくていくつかの温度でスペクトルをとってみるとか。
尿素は220nm付近では測定の邪魔になる可能性はあるかもしれませんね。やってみないとわかりませんが。

(無題) 削除/引用
No.7620-4 - 2019/02/01 (金) 06:17:25 - おお
>コメントいただきありがとうございます。酸とか有機溶媒とかを加えながら測定するということですかね。

加えながら測定しないといけない理由があるんですか?尿素などが変性剤でよく使われますが、尿素存在下のスペクトルをとって、非存在下と比べればだめですか?(もし変なことを行っていたらごめんなさい)。

要するにヘリックスが解けると思われる他の条件で、222nmのCDが上がるかどうか確認してみたらどうかと思ったんですが。

そんな事があるかどうかわかりませんが、ベーターシートなどが温度で崩れることによりヘリックスに移行したりすることがあれば面白いかもしれませんね、

(無題) 削除/引用
No.7620-3 - 2019/01/31 (木) 10:40:06 - 凡人a
おお様
コメントいただきありがとうございます。酸とか有機溶媒とかを加えながら測定するということですかね。申し訳ございません。私の研究室で使用しているCDは温度制御の装置は付いているのですが、滴定装置は搭載しておらず、滴定しながら測定は難しいかと思います。同じサンプルを複数用意しておいて変性剤?の濃度を振って測定することは可能ですがやったことはありません。実施した方が良いのでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.7620-2 - 2019/01/30 (水) 02:50:13 - おお
詳しくはわからないのですが、温度以外で変性させたらどうなりますか?

CD測定での融解測定 削除/引用
No.7620-1 - 2019/01/29 (火) 17:06:53 - 凡人a
見ていただいた方ありがとうございます。私は修士2年で生化学系の研究室に所属しています。私の実験では、タンパク質の変異体を大腸菌に発現させ、温度を上げながら222nmのCDを測定することで変異ごとの融解温度を出しているのですが、ほとんど全ての変異体ではシグモイド様(S字)の融解曲線を得ているのですが、ある変異体だけ逆S字になる変異体があり、その意味がわかりません。全ての変異体は測定前に190-300nmのスペクトルを測定していてほとんど同じ構造だと考えています。縦軸はCDです。拙い文章申し訳ございませんがどなたか分かる方よろしくお願いいたします。

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