Bio Technical フォーラム

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複数回の定PCRのグラフ化 トピック削除
No.7506-TOPIC - 2018/12/21 (金) 15:47:05 - 遺伝子工学
培養細胞で同じ実験を3回以上繰り返して、定量PCRのグラフを作るときどのようにされているのか、ご意見いただければ幸いです。
独立した各実験毎に、RNA抽出・cDNA合成・qPCR（ΔΔCT法）を行っています。
野生型を1としたときの変異型の値をとると、各回のcDNA合成の効率の違いは気にせずに済むかなと思うのですが、この方法で変異型のみにエラーバーをつけるということで統計的には問題ないでしょうか。
アドバイスよろしくお願いいたします。
　
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(無題) 削除/引用
No.7506-2 - 2018/12/21 (金) 16:38:04 - おお
そういうやり方はありです。Fold changeでTestだけのグラフも見かけます。

どうしても抵抗があるなら、以下のURLに示すようなPaired T testで使うようなグラフを書いてもいいかと思いますが、検定方法とグラフの示す意味合いがをあわせたほうがいいでしょう。


http://s3.amazonaws.com/cdn.graphpad.com/faq/918/images/918paired.png

複数回の定PCRのグラフ化 削除/引用
No.7506-1 - 2018/12/21 (金) 15:47:05 - 遺伝子工学
培養細胞で同じ実験を3回以上繰り返して、定量PCRのグラフを作るときどのようにされているのか、ご意見いただければ幸いです。
独立した各実験毎に、RNA抽出・cDNA合成・qPCR（ΔΔCT法）を行っています。
野生型を1としたときの変異型の値をとると、各回のcDNA合成の効率の違いは気にせずに済むかなと思うのですが、この方法で変異型のみにエラーバーをつけるということで統計的には問題ないでしょうか。
アドバイスよろしくお願いいたします。
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