いつも拝見させてもらっています。
この度RNAi libraryを購入しました。
これを1x10^10 cfu / ugオーダーの大腸菌にエレクトロポレーションで形質転換後、10mmの大腸菌ペトリディッシュにプレートする予定です。
指示書に従い、1ディッシュあたり、50000コロニーになるように大腸菌を捲くようにとあります。(addgene社)
もちろんそれは隣り合う大腸菌が接触しないように、ライブラリにバイアスがかからないように、という意図だと思うのですが、ディッシュに撒くコロニー数を”50000コロニーになるように”する際はどのようにすればいいでしょうか?
導入DNA量は指示書に従い、1コンピテントセルあたり、50ng使用します。
Competencyが1x10^10 cfu / ugならば、0.05x10^10 cfu / 50 ngということになるかと思います。
つまり5x10^8のコロニーが出現する計算となり、50000コロニー/ディッシュで撒くとなると、10000ペトリディッシュに撒くということになってしまうのですが、このような計算ではないのでしょうか?
100枚ほどに撒くことを予想していたので、困惑しています。
ご意見いただけますと幸いです。よろしくお願いいたします。 |
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