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(無題) 削除/引用 No.7460-4 - 2018/12/07 (金) 17:10:43 - たいぞう おお様 いつもお世話になります。 Image Jで色々出来るようなので、頑張ってみようと思います。 toto様 教えていただき、有り難うございます。 amazonから教本を購入して、いじっている最中ですが、Image Jで色々出来るようですね。しっかり身につけたいと思います。 大学からの返事は当てに出来ないので大変助かりました。

(無題) 削除/引用 No.7460-3 - 2018/12/07 (金) 13:36:20 - toto ImageJのマクロでDrawRandomDotsというのが https://imagej.nih.gov/ij/macros/ の中にあります。これは // This macro draws 25 random dots on the active // image in the current foreground color. dotSize = 25; width = getWidth(); height = getHeight(); for (i=0; i<25; i++) { x = random()*width-dotSize/2; y = random()*height-dotSize/2; makeOval(x, y, dotSize, dotSize); run("Fill"); } run("Select None"); となっていて、この25を適当なサイズに変えてマクロを走らせれば、そのサイズの円をランダムに描いてくれます。これのrun("Fill")の代わりにrun("Add To Manager")にすれば、指定サイズの円をROIとして選択したROI managerのリストができています。これは円なので、四角にしたい場合はmakeOvalをmakeRectangleにすればできます。これで任意の領域を選択してそこの解析ができるようになります。

(無題) 削除/引用 No.7460-2 - 2018/12/07 (金) 10:52:25 - おお たとえばデーターとは別に、同じピクセルサイズのTIFなどのファイルに何箇所か円または四角を書いて、データーにlayerなどで重ねて、その円や四角の内側を解析すればどうですか？ 自分ですでに顕微鏡画像をとったか見てしまっていてそのイメージで先入観ができてしまっているというなら、データーをみてない人に作ってもらえば無作為といえるでしょう。

Random Spot Webツール 削除/引用 No.7460-1 - 2018/12/07 (金) 00:58:45 - たいぞう 免疫染色で染まっている切片上の部位が、場所によってばらつきがあるため、複数の切片を比べた時に、どの切片が沢山染まっているのか、客観的に判断出来ません。 それで、論文から、Image Jというツールを使えば、染まっている面積を割り出せることを知りましたが、自分が選んだ部位だけの面積を出してしまうと恣意的になってしまうため、ランダムに選ばせたいです。 そのためのツールとしてleads universityがRandom Spotというウェブツールを公開しているのを知ったのですが、ダウンロード出来ずに困っています。 大学に問い合わせていますが、返事が来るか分りません・・・。 どなたか、似たようなツールをご存じないでしょうか？ どうぞよろしくお願いいたします。

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