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スケールバーがあまりに細すぎる件についてすこし トピック削除
No.7440-TOPIC - 2018/11/28 (水) 13:55:16 - 1.1
論文の写真にスケールバーをいれたいです。顕微鏡で写真撮影した際に自動で入れられるので入れたのですが論文Fig用に写真を縮小すると細すぎて良く見えなくなります。撮影時にバーの太さを最大に設定しても多少見えるようになります
がでも見えにくいです。どうしたらよいでしょうか。
 
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No.7440-7 - 2018/11/29 (木) 11:31:16 - seventh
画像の長さ/pixel比が分かれば、imageJなどで後付は可能です。
顕微鏡側のソフトのほうでも同じような処理をしているはずです。
顕微鏡から出力するときには解像度が維持される形式である必要はありますが。
長さ/pixelのデータは納入時に補正されたものが付属ソフト内に保存されていると思います。経年でずれてくるかもしれませんので。厳密な値が必要な場合は校正をしたほうが良いです。

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No.7440-6 - 2018/11/28 (水) 17:02:50 - おお
>厳密には長さがおなじにはならない

もっというと長さをピクセル単位にして図に書き込まれているので、顕微鏡画像取得用のソフトで何ピクセルかに変換できるか、その情報がどこかで見れるはず。同じピクセルの長さのものを作れば理論上同じ長さ。デジタルだから1ピクセル以下の単位はなくきっちりあわせれるはず。

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No.7440-5 - 2018/11/28 (水) 16:19:47 - AP
自動でスーパーインポーズされるスケールバーの方こそ、信頼にたるものじゃない、というのが私ら世代の常識です。そういうのはあくまでも作業を助けるための目安であって、ちゃんとデータに使うなら、対物マイクロメータや標準スケールのビーズなんかをサンプルと同じ光学系で並行して撮影し写真上の実測値から測定したりスケールバーを描いたりしたものだし、いまでもそれが正統的だと信じています。そう、元来、スケールバーは自分で書き込むものだったんです。


今は顕微鏡もソフトももっと賢くなっているでしょうけれど、スーパーインポーズされるスケールバーはフォーカルプレインが異なると実測とのスレ程度が変わるといったしろものでした。まあ、メーカーがプライドをかけてより正確なものを作っているとは思いますが、国際規格とかで標準化されている計測器ではないでしょうね。

上で書いたような歴史的、技術的な経緯からも、スーパーインポーズされたスケールバーが「元画像の情報」であるとは私は思わない。ましてや人を叱るほどのこともない。本質をわかっていないんじゃないか?

まあ、別に写真に入れ込まなければいけないということはないので、写り込んだバーはそのままにして、外にスケールバーを描いてもいいし、別に中に書き込んでも構わないだろう。出版されている論文でもそういうのあるでしょ。

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No.7440-3 - 2018/11/28 (水) 15:22:52 - 1.1
ありがとうございます。私もそう思い、実際そうやってる人もいるので、イラストレータで同じ長さの、もっと太い線を作り重ね書きしようとおもいましたが、厳密には長さがおなじにはならないから元画像の情報を改変することになるので、やってはいけないとある人に叱られたため、ここで聞く事にしました。(じゃあどうすればいいか聞いたのですが、自分はやったことないので知らないといわれました。)

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No.7440-2 - 2018/11/28 (水) 15:07:55 - おお
作成時にイラストレーターとかフォトショップみたいなソフト使うだろうから、上書きしたらいいんじゃないか。ドットが見えるぐらいに拡大して合わせるとドット数で同じ長さに合わせれるし。

スケールバーがあまりに細すぎる件についてすこし 削除/引用
No.7440-1 - 2018/11/28 (水) 13:55:16 - 1.1
論文の写真にスケールバーをいれたいです。顕微鏡で写真撮影した際に自動で入れられるので入れたのですが論文Fig用に写真を縮小すると細すぎて良く見えなくなります。撮影時にバーの太さを最大に設定しても多少見えるようになります
がでも見えにくいです。どうしたらよいでしょうか。

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