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(無題) 削除/引用 No.7415-6 - 2018/11/20 (火) 17:34:18 - qq 解りにくかったようですね。 NCBIのproteinに行って、適当なACを入力（Q9BI40.1 Q93170.2 Q8MYM9.1 Q8MNU8.1 Q688C0.1 Q23571.1 Q20480.1 ）して検索すると、残基数がついた結果が即、出てくるでしょ？ こちらで試してみると、２００件程度は検索ボックスにペーストして一度に処理できました。 ACがもっと沢山あるのであれば、batch entrez（//www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez） を使うと良いかも知れませんね。 O94966-3は、O94966-2のデータに書いてありますが、仮想的なスプライスバリアントで、NCBIにはクレジットされていないようです。

(無題) 削除/引用 No.7415-4 - 2018/11/20 (火) 13:32:15 - bi2 ncbiで「O94966」と「O94966-3」を検索してみましたか？ つまり、その操作ではなく、Accession No.が間違っていると思いますが。 O94966-3のうち、-3はバージョンを表す部分だと思いますが、その際はO94966.3と記載すると思います。 なんにせよ、操作を分割してそのうちどこまではうまく行くかを試して、トラブルシューティングをしてください。

(無題) 削除/引用 No.7415-3 - 2018/11/20 (火) 11:29:28 - バイオインフォ音痴 ありがとうございます。 下記のサイトを見つけました。 https://sites.google.com/site/yusukekikuchiwebsite/memo/getncbifasta このページの最初の方法をトライしてみると、シークエンスを落とせるものとそうでないものとがありました。 たとえば、「O94966」は落とせるのですが、「O94966-3」はダメですね。 う〜ん、、難しいです。

(無題) 削除/引用 No.7415-2 - 2018/11/19 (月) 21:21:40 - qq NCBI protein で、リストを投げ込むのはだめですか？ listが大きいのであれば、Batch Entrezを使うとよいです。 詳細はNCBIで自分で調べなさいね。

Accession No.からアミノ酸残基数 削除/引用 No.7415-1 - 2018/11/19 (月) 09:42:18 - バイオインフォ音痴 UNIPROTやGENBANK等のAccession No.のリストがあります。 これらのタンパク質について、アミノ酸配列の全長が知りたいのですが、1本1本手作業で調べるのではなく、リストごと放り込むと結果（残基数）が帰ってくる、といったサイトはありませんか？

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