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CRISPR標的配列を非コード鎖から選ぶ意義 トピック削除
No.7209-TOPIC - 2018/09/06 (木) 18:41:28 - CRISPR初心者
いつも参考にさせて頂いております。

原核微生物（細菌）ででCRISPR/Cas9によるゲノム編集を行うプラスミドをAddgeneより分譲してもらいました。
Referenceもプロトコルも読んだのですが、理解できない点があるので、お分かりになる方がいればご教授お願いします。

protospacer配列を選定する条件として
１．PAM配列を3'に持つ20塩基
２．非コード鎖

とあり、２についてがよくわかりません。
非コード鎖である必要はないのではないかと考えますが、何の理由でしょうか。

細菌で相同組換えの活性が高いため、プラスミド内にフレームシフトを起こすためのediting templateを組み込んで用いるプラスミドです。
このあたりが、非コード鎖から選ぶ理由でしょうか。
　
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CRISPR標的配列を非コード鎖から選ぶ意義 削除/引用
No.7209-1 - 2018/09/06 (木) 18:41:28 - CRISPR初心者
いつも参考にさせて頂いております。

原核微生物（細菌）ででCRISPR/Cas9によるゲノム編集を行うプラスミドをAddgeneより分譲してもらいました。
Referenceもプロトコルも読んだのですが、理解できない点があるので、お分かりになる方がいればご教授お願いします。

protospacer配列を選定する条件として
１．PAM配列を3'に持つ20塩基
２．非コード鎖

とあり、２についてがよくわかりません。
非コード鎖である必要はないのではないかと考えますが、何の理由でしょうか。

細菌で相同組換えの活性が高いため、プラスミド内にフレームシフトを起こすためのediting templateを組み込んで用いるプラスミドです。
このあたりが、非コード鎖から選ぶ理由でしょうか。
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