Bio Technical フォーラム

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タンパク質構造モデリング トピック削除
No.719-TOPIC - 2012/07/06 (金) 08:50:27 - あ
ほ乳類のタンパク質を扱っていますが、最近、バクテリアホモログの結晶構造が公開されました。相同性が比較的高いので、バクテリアの構造に人の配列を重ねたいのですが、オンラインのいいサイトがあったら教えてください。PDBのアクセッション、タンパク配列等はすべて手に入ります。
 
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(無題) 削除/引用
No.719-3 - 2012/07/06 (金) 13:00:54 - qq
こんなのがあります。
swissmodel.expasy.org
www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre/
あとpymolやspdbvのようなビュアがある方がよいです。

(無題) 削除/引用
No.719-2 - 2012/07/06 (金) 10:55:13 - yutan
TopMatchを使用しています。

タンパク質構造モデリング 削除/引用
No.719-1 - 2012/07/06 (金) 08:50:27 - あ
ほ乳類のタンパク質を扱っていますが、最近、バクテリアホモログの結晶構造が公開されました。相同性が比較的高いので、バクテリアの構造に人の配列を重ねたいのですが、オンラインのいいサイトがあったら教えてください。PDBのアクセッション、タンパク配列等はすべて手に入ります。

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