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NGSにおけるshort insert 削除/引用 No.7188-1 - 2018/09/01 (土) 15:59:44 - ngs 毎度勉強させて頂いております。 このたび質問したいのは、NGSにおいてinsert長が短く(例えば10bp)フラグメントの端を読み超える場合、シーケンサーのアウトプットはどうなるのか、ということです。 [75bpアダプター][insert][75bpアダプター] のようなライブラリーを調製した場合、insertが短いときに150bpで読むとアダプターを読み超えますよね？ 以前ある会社に伺ったところ、アダプターを読み超えてもフローセル基盤のPolyA(T)が10-20bpほどあり、そこまでは読むと言われましたが、それでも足りない場合はアウトプットされないと聞きました。 このアウトプットされないというのは、Pass Filterを通す以前にアウトプットされないのか、Pass Filterによって排除されるのかどちらか、詳しい方に教えて頂きたいです。 よろしくお願いします。

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