Bio Technical フォーラム

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大量のデータのblast トピック削除
No.7139-TOPIC - 2018/08/14 (火) 00:38:09 - トム
900万個のfasta形式のデータがあるのですが、
これらをblastで解析するにはどうすることを考えております。

検索するとlocal blastが候補に挙がりましたが、
容量の小さなPCでも解析可能でしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.7139-2 - 2018/08/14 (火) 08:02:43 - 橘
クエリはアミノ酸配列か塩基配列か、検索対象データベースは何か、どれくらいの類似度のものまで拾ってほしいのか、で大きく変わるので、これだけの情報では誰も答えられませんよ。

大量のデータのblast 削除/引用
No.7139-1 - 2018/08/14 (火) 00:38:09 - トム
900万個のfasta形式のデータがあるのですが、
これらをblastで解析するにはどうすることを考えております。

検索するとlocal blastが候補に挙がりましたが、
容量の小さなPCでも解析可能でしょうか？
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