Bio Technical フォーラム

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conforcal、画像の取り扱いについて トピック削除
No.7098-TOPIC - 2018/07/24 (火) 09:00:17 - たろう
いつも勉強させていただいております
現在当研究室ではCaco-2細胞のapical側に発現している標的、ZO-1、核を染色し、共焦点レーザースキャン顕微鏡で撮影しています。それぞれ発現している高さが若干異なるため、画像編集ソフトを用いて異なる高さの画を重ねたいと考えております。そこで以下の2点について意見をお聞かせいただきたいです。

1. 画像について一般的にどこまで加工が許されるか
2. 目的に適した画像編集ソフト (有料 or 無料) について

皆様のお力添えお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.7098-4 - 2018/07/26 (木) 21:08:52 - たろう
皆様お力添え感謝いたします
imageJで試してみたいと思います

(無題) 削除/引用
No.7098-3 - 2018/07/24 (火) 12:08:36 - TS
どこまで「加工」しようとしているのかがいまひとつわかりませんでしたが、
異なるZ軸の画像を重ね合わせるのは「加工」ではない気がします。
単なる重ね合わせの画像ですから、
異なる高さの画像をMergeした、と方法に書けばよいだけではないですか。

Zスタッキングは「加工」になるとは思いますが、その方法と実施する理由を説明すれば、問題ない気がします。ただ、共局在の解釈には注意が必要ですね。

ZO-1とApical側の分子の局在を見ているということですが、
おおさんのおっしゃるような3D構築も1つの手と思います。
ただ論文投稿となると、2Dのほうが取り扱いが容易かなと思うところで、
XZあるいはYZ軸の画像を作るのもしばしば行われると思います。

画像編集ソフトについては、ファイル形式にもよるかもしれませんが、無料のImage-Jで大概のことはできると思います。
重ね合わせ、Zスタックは少なくともできますね。

(無題) 削除/引用
No.7098-2 - 2018/07/24 (火) 09:30:13 - おお
Z Stackingならまあまあやられる手法だけど。
どこまで画像の加工と言うけど、これこれの画像二枚を重ねたと明記していれば手続き上問題がない。それでもってそれが意味があるのかどうかとかツッコミが来た場合説明できなければ論文が通せないだけのはなし。そういう意味ではZ Stackingのほうがわかりやすい。もちろん何れにせよ違う高さのシグナルを合わせているわけだから共局在は言えない。

さらにそれよりは3Dに起こしてデーターにしたほうがわかりやすいのではないかと思う。

conforcal、画像の取り扱いについて 削除/引用
No.7098-1 - 2018/07/24 (火) 09:00:17 - たろう
いつも勉強させていただいております
現在当研究室ではCaco-2細胞のapical側に発現している標的、ZO-1、核を染色し、共焦点レーザースキャン顕微鏡で撮影しています。それぞれ発現している高さが若干異なるため、画像編集ソフトを用いて異なる高さの画を重ねたいと考えております。そこで以下の2点について意見をお聞かせいただきたいです。

1. 画像について一般的にどこまで加工が許されるか
2. 目的に適した画像編集ソフト (有料 or 無料) について

皆様のお力添えお願いいたします。

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