Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

CMV enhancerからの距離 トピック削除
No.7081-TOPIC - 2018/07/15 (日) 15:36:34 - xyz
CMV enhancerと何らかのプロモーターは連結したセットで使われることがほとんどだと思いますが、間に無関係の配列を挟んで距離を開けた場合、どれくらいまで効果が続くものなのでしょうか?
また関連して、上流や下流の遺伝子の発現も増幅してしまうようなことがあるのでしょうか?

エンハンサーというと数kb〜数100kbまで効くようなものなど様々ありますが、CMVについてはどうなのかなと思い簡単に調べてみましたが、該当する文献が見つかりませんでした。
どなたか情報をお持ちでしたら教えていただけると助かります。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.7081-3 - 2018/07/15 (日) 16:58:20 - AP
>エンハンサーというと数kb〜数100kbまで効くようなものなど様々ありますが、

それは個々のエンハンサーによる違いと言うより、染色体というコンテクストのなかでどのような位置取りにあるかによると考えるべきです。
たとえばインシュレーターで区切られた区画内なら効くけれどインシュレーターを越えては効かないなど。染色体のコンテクストから離れた人工コンストラクトでは話が別です。むしろコンストラクトの方が障壁無く、距離の制限なしに効くとも言えますが、そこまで大きな距離をとることのできるコンストラクトはないわけで。

コンストラクトベースの実験でプロモーター/エンハンサの距離が比較的短いケースで一つ言われていることは、プロモータからのエンハンサーの距離と効きやすさには周期性があるということ。たしか10 bpごとにピークがあってずれると下がる。これはDNAが二重らせんであるためにプロモータからの距離が変われば転写ファクターが結合する向きも変わり、プロモータと相互作用するのに適した向きにあるときに効くからだといいます。

CMV enhancerからの距離 削除/引用
No.7081-1 - 2018/07/15 (日) 15:36:34 - xyz
CMV enhancerと何らかのプロモーターは連結したセットで使われることがほとんどだと思いますが、間に無関係の配列を挟んで距離を開けた場合、どれくらいまで効果が続くものなのでしょうか?
また関連して、上流や下流の遺伝子の発現も増幅してしまうようなことがあるのでしょうか?

エンハンサーというと数kb〜数100kbまで効くようなものなど様々ありますが、CMVについてはどうなのかなと思い簡単に調べてみましたが、該当する文献が見つかりませんでした。
どなたか情報をお持ちでしたら教えていただけると助かります。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。