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(無題) 削除/引用 No.7078-5 - 2018/07/15 (日) 05:52:15 - おお ＞ばらついた場合にどうするべきかなど ばらつくかもしれませんけどばらつくと思っているということはどういったことが原因になるとか懸念があるわけですよね。漠然すぎてよくわからないです。 正常部サンプル間でのｄCtの比較もやっておけばこの実験が成り立っていることが示されるかもしれませんね。

(無題) 削除/引用 No.7078-4 - 2018/07/14 (土) 13:38:58 - xyz 腫瘍の場合、内在性のコントロールは複数調べてコントロール足り得ることを確認しておかないと不安ですよね 細胞腫によって傾向も異なりそうですし

(無題) 削除/引用 No.7078-3 - 2018/07/14 (土) 07:33:46 - り 正常部ΔCtの前に、腫瘍部がΔCt（相対定量）で良いのか、よく分かりません。腫瘍の場合、内在コントロールのコピー数が保証されない（例えば、RNasePが乗っている染色体が異倍体になっている場合など）ように思うのですが？ また、腫瘍部が、ほぼ100%近く腫瘍細胞からできている（例えば、白血病患者さんの血液から、白血病細胞をソートして純化したサンプル、など）場合と、固形癌のようにストローマ細胞の混入が避けられない場合では、アプローチが異なるかもしれません。

臨床検体を用いた遺伝子コピー数の解析・定量について 削除/引用 No.7078-1 - 2018/07/13 (金) 13:52:00 - TK 癌のある遺伝子コピー数についての検討を行っています。 臨床検体で、患者毎に正常部と腫瘍部の組織サンプルを持っており、 内在性コントロールにはRNasePを使用しています。 ΔΔCt法を用いた定量を考えていますが、 腫瘍部ΔCtから引くものとして、患者毎の正常部ΔCtで問題ないのでしょうか、 前提として正常部分は目的とする遺伝子コピー数は変わらないものと考えてはいますが、ばらついた場合にどうするべきかなど、悩んでいます。 最終的には全検体の正常部ΔCt平均値をキャリブレータ-にしてしまう、なども考えましたが、論文化などを目指す場合、どのような計算法が適切なのでしょうか？ 初歩的な質問ですみませんが、ご意見いただきたく思います。

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