遺伝子の研究のかなりの初学者です。非常に初歩的な質問で申し訳ありません!
エンハンサーのメチル化(イルミナのEPICでデータを取りました)に注目して、遺伝子の発現変動と相関比較をしようと思っているのですが、そもそもエンハンサーの位置は、ch番号で特定などってされているのでしょうか?
出来るならば、IgVなどのブラウザにエンハンサーの位置を表示し、その位置のCのメチル化を重ねて表示するなどしたいのですが・・・・
ch番号などが分かればそれが出来るのでしょうが・・・・
そういった事ができなければ、「TSSから1500塩基以上離れていて、CpGサイトである領域」をエンハンサーとして認識してしまってよいものでしょうか?
非常に初歩的な質問で申し訳ありません。 |
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