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(無題) 削除/引用 No.6971-4 - 2018/06/04 (月) 18:11:56 - xyz お好きなのをどうぞ https://www.google.co.jp/search?q=go+analysis+network+function+tool&tbm=isch

(無題) 削除/引用 No.6971-3 - 2018/06/04 (月) 17:49:24 - GO GO解析でもしてみたらいかがでしょう。 https://heavywatal.github.io/bio/gene_ontology.html https://bi.biopapyrus.jp/pathway/go/

(無題) 削除/引用 No.6971-2 - 2018/06/04 (月) 00:43:26 - RNAseq STRING interaction networkでも多数のタンパク質につき表示することができました。 他のサイトと比較ができればと思っています。ご存知の方いらっしゃいましたら宜しくお願いいたします。

RNAseqで上位遺伝子100個の機能的な関連性を図示する方法 削除/引用 No.6971-1 - 2018/06/03 (日) 22:22:00 - RNAseq いつも勉強させていただいています。 私はあるセルラインを薬剤処理して、その前後で変わる遺伝子をRNAseqを利用して調べました。 上位100個を選んで、一つずつ論文検索してどのような遺伝子なのかを調べていますが、もしその100個をクラスタリングというのでしょうか、関連性を紐で結んで表示させるような簡単なフリーなサイトがあれば、ざっくりどのような遺伝子が100個に含まれているのか一目瞭然なのではないか、と考えました。 STRING interaction networkというサイトは一つの遺伝子につき、その遺伝子と相互作用するものを表示させるのは便利ですが、100個の遺伝子をqueryに入力し、一度に表示させる機能はありませんでした。 ご存知の方がいらっしゃいましたら、ご教示いただけませんでしょうか？ ちなみに学内で有料でクラスタリングをしてくれる研究室はありますが、できれば自力で行いたいです。 よろしくお願いいたします。

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