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欠損値があるAUC トピック削除
No.6905-TOPIC - 2018/05/08 (火) 14:15:53 - ねこてんLOVE
お世話になります。以下ご教示いただければ幸いです。

ある変数データを経時的に取得しました。

例
１分後・・・５
２分後・・・７
３分後・・・１３
４分後・・・１８
５分後・・・６
６分後・・・３

ここからAUCのグラフを作成致しました。するとちょうど逆U字型のグラフになると思います。

さて、上記の例で欠損値があるマウスの場合、例えば５分後のデータが得られなかった場合、逆U字型のグラフになることはわかっているため、４分後のデータと６分後のデータをつないだ中点を仮の５分後のデータとして扱ってもよろしいのでしょうか。このような処理の仕方は一般的ではありませんか？

ご教示いただければ幸いです。
　
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(無題) 削除/引用
No.6905-7 - 2018/05/18 (金) 00:34:27 - asan
オミックスデータなどの大規模解析の場合は、統計学的に欠損値推定をかけることは
不可能ではありませんがおっしゃるような実験系でどこまで許されるかは結局のところ論文の主張やバリデーション実験等の結果にもよるでしょう。

極論を言えば2点の中間値を用いたとしても、それをちゃんと論文に記載していたならばダメかどうかはレビューワーやエディターの判断によるとしか言えない事になります。

サイエンティフィックに明らかにダメなやり方というのは当然ありますが、絶対にこうしなければいけないという訳でもないので、一番ベターなのは取り直しですが、それが難しいというなら類似の解析をしてる論文を探して同じような根拠で処理するのが問題は少ないかと思います。

(無題) 削除/引用
No.6905-6 - 2018/05/10 (木) 03:30:04 - おお
>上記の例で欠損値があるマウスの場合、例えば５分後のデータが得られなかった場合

これは５分で測れなかったマウスも測れたマウスもいるということですか？

(無題) 削除/引用
No.6905-5 - 2018/05/08 (火) 23:28:43 - ふみ
1番良い対応；データの取り直し

次点；欠損値のあるマウスの他の時点データも削除 (AUCは個体間ばらつきが少ないことが多いのでn数減っても大きな問題がないことが多いのではないか)

次次点；全個体のデータから5分データを削除

(無題) 削除/引用
No.6905-4 - 2018/05/08 (火) 18:58:01 - おお
>４分後のデータと６分後のデータをつないだ中点を仮の５分後のデータとして扱ってもよろしいのでしょうか。

だめでしょう。もとめた５分のときの数値はデーターでなく推測したあたいです。
もっと単純な蛋白定量のスタンダードで直線に乗る場合も、１と１．５でデーターをとって、その値の平均値などから、１．２５のデーターポイントを追加してスタンダードカーブの計算をしませんよ。

re 欠損値があるAUC 削除/引用
No.6905-3 - 2018/05/08 (火) 17:21:19 - ねこてんLOVE
ｍ先生

早速のご回答ありがとうございました。

おっしゃる通り再実験が最適と思います。しかし少し複雑な実験で再検に時間、労力、費用がかかってしまうため、お聞きしました。

論文に明記して、それでもアクセプトしてもらえるところに出すしかなさそうですね。

ご回答、誠にありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.6905-2 - 2018/05/08 (火) 15:03:23 - m
明記しておけばそこまで問題にはならないと思いますが、
出来ることならもう一度取り直すべきだと私は思います。

ポイント数がもっと多く、かつ変曲点に近くない場合などでは気になりませんが、
例の様なデータですと1点の推移が激しく、落ちるタイミングのポイントのためそこが抜け落ちてしまうのはデータとしていかなるモノかと。

欠損値があるAUC 削除/引用
No.6905-1 - 2018/05/08 (火) 14:15:53 - ねこてんLOVE
お世話になります。以下ご教示いただければ幸いです。

ある変数データを経時的に取得しました。

例
１分後・・・５
２分後・・・７
３分後・・・１３
４分後・・・１８
５分後・・・６
６分後・・・３

ここからAUCのグラフを作成致しました。するとちょうど逆U字型のグラフになると思います。

さて、上記の例で欠損値があるマウスの場合、例えば５分後のデータが得られなかった場合、逆U字型のグラフになることはわかっているため、４分後のデータと６分後のデータをつないだ中点を仮の５分後のデータとして扱ってもよろしいのでしょうか。このような処理の仕方は一般的ではありませんか？

ご教示いただければ幸いです。
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