全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.6837-5 - 2018/04/19 (木) 18:53:52 - 寄生 mon　様 追加のフォロー、ありがとうございます。 先のxyzさんの挙げた論文を読んだ時に、宿主に依存した増幅になるので、その影響が反映されているんだなと思いました。 (細菌の様に栄養等の周辺環境に応じて速やかに増殖するタイプへの寄生と、より複雑な制御に基づく増殖となる真核生物への寄生では、取るべき戦略も異なるのだなと。)

(無題) 削除/引用 No.6837-4 - 2018/04/19 (木) 12:37:55 - mon 真核生物と原核生物の翻訳開始メカニズムの違いに着目すると、以下のような違いがありますが、大腸菌の例しか知らないので普遍的か否か判断できません。あしからず。 https://ja.wikipedia.org/wiki/シャイン・ダルガノ配列 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26268350

(無題) 削除/引用 No.6837-3 - 2018/04/19 (木) 12:12:52 - 寄生 xyz　様 考えるきっかけの一つとなります論文を挙げて下さり、ありがとうございました。Bioinformaticsの解析技術自体は専門外ですが、目を通して概念的に理解しました。 また、他のご意見を待っていた事もあり、御礼が遅くなり、すいませんでした。

(無題) 削除/引用 No.6837-2 - 2018/04/11 (水) 20:55:40 - xyz Significant differences in terms of codon usage bias between bacteriophage early and late genes: a comparative genomics analysis https://bmcgenomics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12864-017-4248-7?site=bmcgenomics.biomedcentral.com Conclusion: The codon distribution in large fractions of bacteriophage genomes tend to be different in early and late genes. It seems that various additional genomic features (e.g. NTB and GC content) tend to be associated with this signal. This phenomenon seems to be related to various aspects of the viral life cycle, and to various intracellular processes. A similar signal may be observed in human viruses but it seems significantly less frequent.

ウイルスとバクテリオファージのゲノム配列での区別 削除/引用 No.6837-1 - 2018/04/11 (水) 17:48:21 - 寄生 自分の検索が適切でないからかもしれませんが、明確な結論が見つけられなかったため、こちらを利用させて頂きます。 (バクテリオファージにはRNAゲノム型が非常に少ないと言う事は分かりました。) 真核生物に感染するウイルスと細菌に感染するバクテリオファージは、各々のゲノム配列を並べた時に、何等かの特徴的な違いから区別できるものでしょうか？ データベースの有無という観点ではなく、真核生物だとイントロンが存在するのに対して、原核生物は見られない、といった感じで、特徴的な違いがあるのかないのかという質問になります。100%判別可能でなくても、大凡区別するための特徴でも構いませんので、ご教授下さると助かります。

全5件 ( 1 〜 5 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---