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HMEJとMMEJの違い トピック削除
No.6832-TOPIC - 2018/04/10 (火) 19:39:10 - xyz
homology-mediated end joining (HMEJ)とmicrohomology-mediated end joining (MMEJ)の違いはホモロジー配列の長さが違うだけですよね？

HMEJだとHR経路でいくこともあるようですが、それはともかくこの２つの修復経路は同じように見えます。
では長さの定義は何bp以上はHMEJで、何bp以下はMMEJと決められているのでしょうか？
何か情報や文献あれば教えてください。

あと例えばホモロジー配列が100bp、200bpだとMMEJでしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.6832-3 - 2018/04/10 (火) 20:04:34 - xyz
APさん

そんなには使われてないですが、HMEJでCRISPR上手くいったぜ！って論文とCRISPRのレビューでは名前があがってきます。

Homology-mediated end joining-based targeted integration using CRISPR/Cas9
https://www.nature.com/articles/cr201776

上記論文のイントロに長さの話が少し出てきますが、ざっくりしたもので定義が明確に定まっていないのかなぁ、と疑問に思いまして。。。

(無題) 削除/引用
No.6832-2 - 2018/04/10 (火) 19:57:37 - AP
>homology-mediated end joining (HMEJ)
という用語は耳慣れないのですが、そんなに使われてますか？　どういうところで出てきますか？

たぶん、メカニズム自体はMHEJと同じなんだと思います。たまたまDSBの両側に顕著な相同配列があってそこで再結合していたケースを、そう呼んだ人がいるってだけじゃないですかね。

HMEJとMMEJの違い 削除/引用
No.6832-1 - 2018/04/10 (火) 19:39:10 - xyz
homology-mediated end joining (HMEJ)とmicrohomology-mediated end joining (MMEJ)の違いはホモロジー配列の長さが違うだけですよね？

HMEJだとHR経路でいくこともあるようですが、それはともかくこの２つの修復経路は同じように見えます。
では長さの定義は何bp以上はHMEJで、何bp以下はMMEJと決められているのでしょうか？
何か情報や文献あれば教えてください。

あと例えばホモロジー配列が100bp、200bpだとMMEJでしょうか？
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