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(無題) 削除/引用 No.6826-3 - 2018/04/09 (月) 19:04:16 - AP ゲノムが読まれているような生物だったらいけると思うけど。 Chlorocebusならやられているだろう。 MASCOTみたいのでMSフィンガープリンティングでタンパク質同定するというのは、結局、NCBIをはじめ、各種データベースに登録されているタンパク質のアミノ酸配列をバーチャルにプロテアーゼ消化した断片の質量のパーターンとの一致を見るんだよね。データーベース全体に対して行うか、そのなかから選んだサブセットで生物種を限るかってだけで。

(無題) 削除/引用 No.6826-2 - 2018/04/09 (月) 16:10:41 - おお まあペプチドシーケンスをやるなら配列は同定できるけど。 それでもってその後どのようにするかはまあやれることはいろいろあると思うけど、、、

質量分析は人やマウスの細胞以外のものでも分析、照合は可能か 削除/引用 No.6826-1 - 2018/04/09 (月) 14:24:59 - OK これから初めて質量分析を行おうとしているものです。 諸事情により、研究室にてすでに樹立されている安定的遺伝子導入後のCOS-7から免疫沈降し、結合するタンパク質を同定することを目標にしています。 COS-7はアフリカミドリザルの腎臓細胞とのことですが、Mascottで検出されたペプチドを照合する際、人やマウス以外のものでも、例えばCOS7やCHO細胞でも問題なく同定は可能なのでしょうか？ 質量分析はこれまで経験がなく、大学内の共通施設で受託にて行おうと考えています。 その方に聞くのが早いというのはありますが、ここでもご意見を聞かせていただけるととても参考になります。よろしくおねがいします。

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