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臨床sampleでのRT-qPCRについて トピック削除
No.6792-TOPIC - 2018/03/23 (金) 21:12:11 - 駆け出し大学院生
RT-qPCRのハウスキーピング遺伝子のCt値について相談させて下さい。

Ct値で若干のばらつきがでると思うのですが、実際どれぐらいのばらつきを許容されているでしょうか??

他施設共同研究で臨床sample(悪性腫瘍)のRNAを拝受して、解析しているのですが、、、
他研究機関で抽出したRNAが若干Ct値がばらついてしまいます。(Averageの+-1.5程度)

nanodropでtotal RNA量測定後、逆転写反応はこちらで行っています。

臨床sampleで数を増やせばこれぐらいはばらつくものなのでしょうか??

悪性腫瘍のpathologyはsubtypeはありますが統一されています。

自施設で細胞株同士、臨床sample同士ではCt値はほぼばらつきません。(Average+-0.3程度)
のでハウスキーピング遺伝子は問題ないと思うのですが。
 
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臨床sampleでのRT-qPCRについて 削除/引用
No.6792-1 - 2018/03/23 (金) 21:12:11 - 駆け出し大学院生
RT-qPCRのハウスキーピング遺伝子のCt値について相談させて下さい。

Ct値で若干のばらつきがでると思うのですが、実際どれぐらいのばらつきを許容されているでしょうか??

他施設共同研究で臨床sample(悪性腫瘍)のRNAを拝受して、解析しているのですが、、、
他研究機関で抽出したRNAが若干Ct値がばらついてしまいます。(Averageの+-1.5程度)

nanodropでtotal RNA量測定後、逆転写反応はこちらで行っています。

臨床sampleで数を増やせばこれぐらいはばらつくものなのでしょうか??

悪性腫瘍のpathologyはsubtypeはありますが統一されています。

自施設で細胞株同士、臨床sample同士ではCt値はほぼばらつきません。(Average+-0.3程度)
のでハウスキーピング遺伝子は問題ないと思うのですが。

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