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システイン残基の還元アルキル化を評価したい トピック削除
No.6695-TOPIC - 2018/02/16 (金) 16:30:45 - 還元水
タンパク質の質量分析等を行う際に試料の還元アルキル化を行うことがありますが、全てのSH基がアルキル化されているか評価する方法はありますでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.6695-5 - 2018/02/17 (土) 13:37:49 - 還元水
DTNBを使ったSH基の定量法は使えるかもしれませんね。
簡単にできそうなので試してみます。

(無題) 削除/引用
No.6695-4 - 2018/02/17 (土) 10:26:02 - qq
ヨードアセタミドでアルキル化するだろうとおもうけれど、これをヨード酢酸でアルキル化すると2mass減少するだろうから、
1)ヨードアセタミドでアルキル化
2)ヨード酢酸でアルキル化
3)ヨードアセタミドでアルキル化したあとにヨード酢酸で再アルキル化
4)ヨード酢酸でアルキル化したあとにヨードアセタミドで再アルキル化
これら4つをPMFすると判るんじゃないかなあ(やったことないけど)。

(無題) 削除/引用
No.6695-3 - 2018/02/17 (土) 03:48:50 - おお
http://www.funakoshi.co.jp/contents/45991
これってつかえるとおもう?

(無題) 削除/引用
No.6695-2 - 2018/02/17 (土) 02:01:15 - $%
LC/MS/MSでも(かなり小さい蛋白質ならばもしかしたら可能かもしれないですが、低めのカバー率が示すように、一般的には)生成したすべてのペプチド断片を分析できるわけではないので、たぶんすべてのSH基を調べるのはとても難しいとおもいます。

システイン残基の還元アルキル化を評価したい 削除/引用
No.6695-1 - 2018/02/16 (金) 16:30:45 - 還元水
タンパク質の質量分析等を行う際に試料の還元アルキル化を行うことがありますが、全てのSH基がアルキル化されているか評価する方法はありますでしょうか。

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