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5'UTRはプロモーターとして機能するのでしょうか
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No.6639-TOPIC - 2018/01/31 (水) 14:05:27 -
tsugumi
いつも皆様のご意見を参考にしております。
ある論文で、TFEBという転写因子を過剰発現したところ、リソソームタンパク質の遺伝子発現が上昇した、というものがありました。
その論文中ではTFEB結合配列がリソソームタンパク質遺伝子のどこに位置しているかを示した図がありましたが、5'UTRに位置しているものが数多くありました。
5'UTRは転写開始点より下流ですが、転写因子の結合により転写を促進するようなプロモーター領域である可能性はあるのでしょうか。
よろしくお願いいたします。
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No.6639-3 - 2018/01/31 (水) 18:12:39 - AP
プロモータとエンハンサの違いを確認した方がいい。TFEB
5' UTRにある場合もあるのはプロモータじゃなくてエンハンサ。エンハンサはプロモータ上流、下流、数百kbほどの距離でも存在している場合、イントロンに存在している場合なんかもある。
この場合はmRNAの発現の活性化を意味しているようだが、翻訳調節因子が5' UTRに存在する場合もありえる。
(無題)
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No.6639-2 - 2018/01/31 (水) 14:13:40 - おお
>5'UTRは転写開始点より下流ですが、転写因子の結合により転写を促進するようなプロモーター領域である可能性はあるのでしょうか。
あります。転写因子のレビューを探してみてください。もしかしたら古めのものがいいかもしれません。
5'UTRはプロモーターとして機能するのでしょうか
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No.6639-1 - 2018/01/31 (水) 14:05:27 -
tsugumi
いつも皆様のご意見を参考にしております。
ある論文で、TFEBという転写因子を過剰発現したところ、リソソームタンパク質の遺伝子発現が上昇した、というものがありました。
その論文中ではTFEB結合配列がリソソームタンパク質遺伝子のどこに位置しているかを示した図がありましたが、5'UTRに位置しているものが数多くありました。
5'UTRは転写開始点より下流ですが、転写因子の結合により転写を促進するようなプロモーター領域である可能性はあるのでしょうか。
よろしくお願いいたします。
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