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real-time PCRの結果の解析方法
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No.6613-TOPIC - 2018/01/23 (火) 13:26:58 -
初心者
いつもお世話になっております。
度々初歩的な質問で申し訳ないのですが、ご教授お願いします。
現在経時的に回収したtotal RNA(cDNA)を鋳型として、遺伝子A-Eまでの発現量の変化を見たいと思っています(遺伝子間の比較はしないです)。
realーtime PCRで得られた結果の解析ですが、
例えば遺伝子A,B,CについてはΔΔCt法でそれぞれの相対発現量の変化(発現パターン)を見る(遺伝子間ではありません。)。D,EについてはE-method?で相対発現量の変化見る、
ということはしてもよいのでしょうか?
ご教示頂けると幸いです。
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No.6613-5 - 2018/01/26 (金) 13:14:39 -
初心者
おおさん
>A,B,Cは増幅効率がコントロールと比べて許容範囲だったが、D,Eは増幅効率がコントロールとで明らかな違いがあったのでE-methodで比較したで納得がいかない理由がありますか?
特に自分としては納得いかない理由はなかったのですが、自分が知らないルールがあるのかもしれないと不安になり質問いたしました。
回答いただいてありがとうございました。
(無題)
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No.6613-4 - 2018/01/26 (金) 03:38:28 - おお
A,B,Cは増幅効率がコントロールと比べて許容範囲だったが、D,Eは増幅効率がコントロールとで明らかな違いがあったのでE-methodで比較したで納得がいかない理由がありますか?
(無題)
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No.6613-3 - 2018/01/25 (木) 23:19:40 -
初心者
おおさん、回答ありがとうございます。
追加でD,Eについても調べることになったのですが、
A,B,Cと違い、コントロールと増殖効率が大きく異なってしまったものでして…
もう一度、検量線をとる方法で全てリトライした方がいいのかな、と。
(無題)
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No.6613-2 - 2018/01/25 (木) 11:09:48 - おお
納得できる理由があればそれでもいい(消極的な意味になるかもしれないけど)のではないでしょうか。
real-time PCRの結果の解析方法
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No.6613-1 - 2018/01/23 (火) 13:26:58 -
初心者
いつもお世話になっております。
度々初歩的な質問で申し訳ないのですが、ご教授お願いします。
現在経時的に回収したtotal RNA(cDNA)を鋳型として、遺伝子A-Eまでの発現量の変化を見たいと思っています(遺伝子間の比較はしないです)。
realーtime PCRで得られた結果の解析ですが、
例えば遺伝子A,B,CについてはΔΔCt法でそれぞれの相対発現量の変化(発現パターン)を見る(遺伝子間ではありません。)。D,EについてはE-method?で相対発現量の変化見る、
ということはしてもよいのでしょうか?
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