Bio Technical フォーラム

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プライマー産物の分子量 トピック削除
No.658-TOPIC - 2012/06/22 (金) 15:31:08 - らしでむ
マウスを他施設から譲り受けて、交配し遺伝子タイピングをしています。
その施設から教えていただいたプライマーを用いてPCRを行ったところ、産物の分子量が400bpであるはずが300bpの位置にバンドがみられ、不思議に思っています。

プライマーの情報から遺伝子産物の分子量を確認することのできるソフトや方法があれば教えていただきたいと思います。よろしくお願いします。
　
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ありがとうございます 解決済み 削除/引用
No.658-4 - 2012/06/22 (金) 21:52:23 - らしでむ
ＡＰさん、ａａａａさん、有益な情報をありがとうございます。
ａａａａさんの教えていただいたサイトでプライマー産物の分子量を調べたら、３００ｂｐでした。

(無題) 削除/引用
No.658-3 - 2012/06/22 (金) 17:27:37 - aaaa
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?command=start

(無題) 削除/引用
No.658-2 - 2012/06/22 (金) 15:42:38 - AP
Templateとなる全配列が分かっているならば
普通のテキストエディタでも簡単に調べられますよ。
あとはApEとかは結構便利ですね。

プライマー産物の分子量 削除/引用
No.658-1 - 2012/06/22 (金) 15:31:08 - らしでむ
マウスを他施設から譲り受けて、交配し遺伝子タイピングをしています。
その施設から教えていただいたプライマーを用いてPCRを行ったところ、産物の分子量が400bpであるはずが300bpの位置にバンドがみられ、不思議に思っています。

プライマーの情報から遺伝子産物の分子量を確認することのできるソフトや方法があれば教えていただきたいと思います。よろしくお願いします。
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