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有難う御座います。 削除/引用 No.6565-5 - 2018/01/10 (水) 12:51:45 - 駆け出し大学院生 なるほど。勉強になりました。有難う御座います。

(無題) 削除/引用 No.6565-4 - 2018/01/10 (水) 03:31:38 - おお >こちらで使用しているprimerは「Sanger sequenceのためのDNAのPCR用」や「mRNA定量ためののRT-PCR用」なのですが、そのような場合も利点があるのでしょうか？？ 直接的にはないでしょう。もちろんTagがついたプライマーを他の用途で使ったけど、それをシーケンス用に代用することはありえますけど。 定量的なPCRは増幅効率とかありますので、、、もともとそのプライマーを使うということでバリデーションをして使うならありえますが、、、 何れにせよ（特に後者はですけど）、余分なものをつけるとその影響もあるわけで、それが何もしないか、吉に出るか凶に出るかいろいろな可能性があるならないほうがましではあります。

有難う御座います。追伸です。 削除/引用 No.6565-3 - 2018/01/09 (火) 23:28:50 - 駆け出し大学院生 なるほど、、、 タグとして使用する、というのは理解できました。非特異的な配列がprimerに入っていてもPCRはかかるのですね。そこが何か不思議な感じがしますが。 こちらで使用しているprimerは「Sanger sequenceのためのDNAのPCR用」や「mRNA定量ためののRT-PCR用」なのですが、そのような場合も利点があるのでしょうか？？

(無題) 削除/引用 No.6565-2 - 2018/01/09 (火) 22:37:03 - ぷらいまー よくありますよ。 わざと非特異的な配列を挿入する事で、任意のタグや制限酵素認識配列を付加出来ます。 これにより任意の遺伝子を増幅した後、ベクターへのクローニングが可能になります。 また、タグによりタンパク質の検出や精製も可能です。 http://www.promega.co.jp/jp/jp_tech/FAQs/Q&A_FlexiVector.html 参考にどうぞ。

Primerのsense鎖について 削除/引用 No.6565-1 - 2018/01/09 (火) 21:45:44 - 駆け出し大学院生 PCR初心者です。 PCR用のprimer設計で、わざとsense鎖の最初（5'端）に非特異的な配列を挿入することはありますでしょうか？？ 過去の論文を元に最適なprimerを探しているのですが、primer3plusなどで検索するときに、最初のsense鎖の最初の数塩基配列が相補的な配列となっていない場合があるのです。 どうぞ宜しくお願い致します。

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