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タンパク質の凝集 重合 トピック削除
No.6534-TOPIC - 2017/12/21 (木) 01:15:16 - のん
タンパク質に化学的処理を行い、メルカプトアリのSDS_PAGEを展開した際に、バンドが消失してしまいます。
これが本当に凝集していてバンドが消失したか断定できません。
これが凝集によるものか重合しているのか証明する方法はありませんか?
 
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(無題) 削除/引用
No.6534-5 - 2017/12/23 (土) 05:40:57 - あqwせdrftghyじゅmkl
化学的処理って、何したのよ?それ秘密にされるとたぶんみんな答えられない。具体的な試薬とかでなくてもいいので、べつにだれも真似しないから、何系の試薬とか、〜化とかおおざっぱな感じでもいいので書いた方がいい。で非還元では消えないとかなの?凝集/重合、が気になるならばとりあえずスタッキングゲル含めてウェスタンしてみればその日のうちに結論でる案件ではないかと思う。ウェスタンでバンドが消えるのは、1)高分子量化してゲルにはいらない 2)不溶化して沈殿してゲルに入らない 3) 分解した 4)転写されにくくなり、多くがゲルに残る。4)抗体の認識部位やその近傍に修飾/脱修飾がおきて抗体が認識出来なくなった。5)限定分解などがおきた結果、抗体の認識部位が失われた。とかがある。

(無題) 削除/引用
No.6534-4 - 2017/12/22 (金) 10:47:07 - mon
化学的処理によって、バンドとしての可視化(CBB染色?銀染色?)が出来なくなった可能性はありませんか?

(無題) 削除/引用
No.6534-3 - 2017/12/21 (木) 13:19:30 - おお
凝集がどんな状態を考えているのかわかりませんけど、SDSPAGEで検出ができなくてもタンパク質が消えたわけでなく、どこかにあるでしょう。

化学修飾を行ったとありますが、修飾後にその試薬を除去しませんでしたか?していればその操作のときにどこかに行ったかもしれませんし。

それに否定的であるならば、SDSPAGEをする前にそこにあるわけですから、SDSPAGEはあなたの考えていることを示すには不向きなのでしょう。凝縮というか分子間で結合がおこり高分子になっているのなら、ウェルの底とかスタッキングと分離ゲルの境目に詰まっているかもしれません。

またその化学修飾ですごく塩基性に偏った状態になっているならMigrationがおこらない可能性もありますし。

分子量などで分ける生化学的な方法はまあいろいろありますけど、、、

と書いたんだけど「凝集によるものか重合しているのか」ってこの違いはどのように考えているのだろうか。。。と後で気付いた

(無題) 削除/引用
No.6534-2 - 2017/12/21 (木) 12:46:14 - qq
化学的処理がバンドを消失させたのですね。
化学的処理と、メルカプトアリの2つの条件をそれぞれなくした時に、バンドは出てくるのですか?
のんさん、お答えください。

もしよければ、なぜ「凝集して」と考えるのか、仮定をお聞かせいただきたいです。

タンパク質の凝集 重合 削除/引用
No.6534-1 - 2017/12/21 (木) 01:15:16 - のん
タンパク質に化学的処理を行い、メルカプトアリのSDS_PAGEを展開した際に、バンドが消失してしまいます。
これが本当に凝集していてバンドが消失したか断定できません。
これが凝集によるものか重合しているのか証明する方法はありませんか?

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