学部生です。
卒業研究でPCRを行っていますが、以前までバシッと一本で出ていたバンドが2本になる現象に遭遇し当惑しています。
現在、ベクターを鋳型に、インサートした配列をT7、SP6プロモーターのプライマーで増幅させています。
・インサート配列はMCS含め600bp前後
・ポジコンはすでにT7-SP6で増幅させたDNA
・PCRはGo taq、検出はアガロースゲルとミドリグリーンを使用
1ヶ月前までは1つのバンドが得られていましたが、
最近になり、目的のバンドの100bp下にもう一つ薄いバンドが出るようになりました。インサート配列の異なる4サンプルで同様です。
泳動した後のゲルをエチブロで再染色して観察しましたがそちらも2つのバンドでした。
また、アニーリング温度を60℃から65℃に挙げてみましたが、サンプルはPCRがかからずポジコンは2つのままでした。
試薬を変えても変化ありません。
原因が分かる方いましたらよろしくお願いいたします。 |
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