Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

LC-MS 2価イオンのMS2 トピック削除
No.6456-TOPIC - 2017/11/15 (水) 17:48:05 - m
初歩的なことで申し訳ありません。
LC-MSで糖ペプチド分析していますが、
Negativeで2価イオンのMS2フラグメントを得た際に、
1価のイオンは検出されますか?

説明がわかりずらいですね。
例えば、質量3000の糖ペプチドがあるとして
m/z=1499のピーク([M-2H]-)をプリカーサ-イオンとしてMS2を取得します。
そこで、700のフラグメントが得られたとして、
それは1価の([M-H]-)可能性はありますか?

よろしくおねがいします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 解決済み 削除/引用
No.6456-6 - 2017/11/16 (木) 18:01:32 - m
L様。

とても分かりやすい説明ありがとうございます。
理解致しました。

ご教授、ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.6456-5 - 2017/11/16 (木) 17:44:23 - L
追記です。

フラグメントイオンのアイソトープが取得できていれば、価数を判定できます。
m/z 700の隣に、701のイオンがあれば一価、700.5があれば2価ですね。

(無題) 削除/引用
No.6456-4 - 2017/11/16 (木) 17:39:40 - L
一価のイオンである可能性はあります。


ABCDEFGという配列のペプチドがあるとします。
そして、CとFに電荷が乗っているとします。

このとき、DのC末で開裂が起こると、
ABCDおよびEFGの二種類のフラグメントが生成します。
この2つのフラグメントは、当然一価イオンになります。

では、BとCに電荷がのっていた場合はどうなるでしょうか。
DのC末側で開裂が起きると、ABCDの二価イオンが生成します。

このように、プリカーサーのどこに電荷が乗っているかによって、フラグメントの価数も変わってきます。


まとめると、二価のプリカーサーからは、一価もしくは二価のフラグメントイオンが生成する、ということです。

(無題) 削除/引用
No.6456-3 - 2017/11/16 (木) 11:34:58 - m
>[Re:2] qqさんは書きました :
> TOF-MASSしか使わないので見当違いかもしれないけど、一価か二価かは、スペクトルの微細構造を見たら分かるんじゃあないのかなあ?

微細構造では難しいですね...

ピークは他にもいくつか確認しており、
糖ペプチド2価のピークを叩いた時のみ
おそらくペプチド+GlcNAc ionのピークが1価ででるのかを知りたい...というより、

そもそもMSの構造?として
2価を叩いた時に1価が得られるのか、という事をご教授頂けると助かります。
よろしくおねがいいたします

(無題) 削除/引用
No.6456-2 - 2017/11/15 (水) 23:37:03 - qq
TOF-MASSしか使わないので見当違いかもしれないけど、一価か二価かは、スペクトルの微細構造を見たら分かるんじゃあないのかなあ?

LC-MS 2価イオンのMS2 削除/引用
No.6456-1 - 2017/11/15 (水) 17:48:05 - m
初歩的なことで申し訳ありません。
LC-MSで糖ペプチド分析していますが、
Negativeで2価イオンのMS2フラグメントを得た際に、
1価のイオンは検出されますか?

説明がわかりずらいですね。
例えば、質量3000の糖ペプチドがあるとして
m/z=1499のピーク([M-2H]-)をプリカーサ-イオンとしてMS2を取得します。
そこで、700のフラグメントが得られたとして、
それは1価の([M-H]-)可能性はありますか?

よろしくおねがいします。

6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。