あるpromtoer領域のクロマチン構造変換を調べるためにFAIREqPCRを始めました。この過程においては、固定・sonication(断片化)したproductからPCIによるDNA抽出を行います。これにより、凝集したクロマチン構造内に含まれるDNA断片はPCIにより除去され、ゆるまったクロマチン構造のDNAがとれてくると思います。
このPCIによる抽出は、キアゲンなどのDNA purification kitで行っても同じなのでしょうか?つまり、これらのkitでも、タンパクと架橋されたDNAは除去されるのでしょうか?
もし何かご存じの方がおられましたらご教授ください |
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