Bio Technical フォーラム

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fluorogenic substrateについて教えてください トピック削除
No.6421-TOPIC - 2017/10/27 (金) 07:29:52 - Kent
表題のままですが、今AMC (7-amido-4-methylcoumarin)を基質としてプロテアーゼアッセイを行っているのですが、AMCがペプチドにつながっていて、そこから離れると、構造が変わるのだと思っていたのですが、それほど構造が変わっていないのになぜ蛍光を発生するのかということが分からないです。
基本的な質問で、自分でもっと調べろと言われそうですが、質問させてください。
 
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(無題) 削除/引用
No.6421-3 - 2017/10/28 (土) 04:32:21 - Kent
monさん、

サイトありがとうございます。
たしかにアミノ酸がはずれると蛍光がシフトするようです。
助かりました。


>[Re:2] monさんは書きました :
> 蛍光波長がシフトするようです。
> https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/references/molecular-probes-the-handbook/enzyme-substrates/introduction-to-enzyme-substrates-and-their-reference-standards.html
> Aromatic amines, including the commonly used 7-amino-4-methylcoumarin (AMC, A191; spectra), are partially protonated at low pH (less than ~5) but fully deprotonated at physiological pH. Thus, their fluorescence spectra are not subject to variability due to pH-dependent protonation/deprotonation when assayed near or above physiological pH. AMC is widely used to prepare peptidase substrates in which the amide has shorter-wavelength absorption and emission spectra than the amine hydrolysis product.

(無題) 削除/引用
No.6421-2 - 2017/10/27 (金) 08:03:41 - mon
蛍光波長がシフトするようです。
https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/references/molecular-probes-the-handbook/enzyme-substrates/introduction-to-enzyme-substrates-and-their-reference-standards.html
Aromatic amines, including the commonly used 7-amino-4-methylcoumarin (AMC, A191; spectra), are partially protonated at low pH (less than ~5) but fully deprotonated at physiological pH. Thus, their fluorescence spectra are not subject to variability due to pH-dependent protonation/deprotonation when assayed near or above physiological pH. AMC is widely used to prepare peptidase substrates in which the amide has shorter-wavelength absorption and emission spectra than the amine hydrolysis product.

fluorogenic substrateについて教えてください 削除/引用
No.6421-1 - 2017/10/27 (金) 07:29:52 - Kent
表題のままですが、今AMC (7-amido-4-methylcoumarin)を基質としてプロテアーゼアッセイを行っているのですが、AMCがペプチドにつながっていて、そこから離れると、構造が変わるのだと思っていたのですが、それほど構造が変わっていないのになぜ蛍光を発生するのかということが分からないです。
基本的な質問で、自分でもっと調べろと言われそうですが、質問させてください。

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