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転写因子とプロモーターについて トピック削除
No.6409-TOPIC - 2017/10/24 (火) 11:00:24 - fukurou
質問が三つあります。

1転写因子とは転写調節因子と同じものを指すのでしょうか?

2転写因子とはエンハンサーやサイレンサーといったものという解釈でいいのでしょうか?

3転写因子とプロモーターが結合しているかをどのように判別できるでしょうか?


知識不足ですいませんが解答のほうよろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.6409-5 - 2017/10/24 (火) 13:20:21 - おお
調節配列はCis regulatory elementとも言われますね。とCisで表現することもありますね。DNA側をCis、それに対してDNA側に影響を及ぼす因子をTransで表すという概念です。なのでtrans−factorという言い方も存在していたと思います(あまり使わないので気にしなくてもいいかもしれませんけど)。

(無題) 削除/引用
No.6409-4 - 2017/10/24 (火) 12:56:11 - AP
補足
エンハンサー サプレッサー/リプレッサー/サイレンサーなどを総称してtranscription elementと言います。

さっきのふれた提言では
transcription elementを転写因子
transcription factorの方を転写要素
だったような気がする。
だとすると、転写因子の意味の現在でのコンセンサスと逆だ。

(無題) 削除/引用
No.6409-3 - 2017/10/24 (火) 12:47:00 - AP
転写因子(転写調節因子)というと、transcriptional factor(transcriptional regulatory factor)のことでDNA上の調節配列に結合して転写調節にかかわるタンパク質のことなんですけれどね。
紛らわしいことにtranscriptional elementという言葉もあって、こちらは調節配列の方を指します。factorもelementも「因子」と訳しうるので転写因子という言葉は多分に混乱を招きます。

一時期「因子」と「要素」で言い分けようという提唱もあったように記憶します(どっちがfactorでどっちがelementかは忘れた)。私は間違って伝わらにように、話し言葉では英語(カタカナ語)で言うようにしています。

(無題) 削除/引用
No.6409-2 - 2017/10/24 (火) 12:16:02 - moz
レポートの課題ではないよね??
> 1転写因子とは転写調節因子と同じものを指すのでしょうか?
そうです。ただし、転写因子の意味が狭く使われることがあり、basic transcriptional machineryの構成因子を指す場合があります。

> 2転写因子とはエンハンサーやサイレンサーといったものという解釈でいいのでしょうか?
違います。エンハンサーやサイレンサーはDNA配列を指します。

> 3転写因子とプロモーターが結合しているかをどのように判別できるでしょうか?
ものの本・論文(総説)を読んで調べた方がよいですが、代表的なものとして
DNase footprinting assay, gel-shift assay (gel retardation assay, 抗体を用いたsupershitという現象も有用), (luciferase) reporter assay, ELISA, Chromatin-IP(クロマチン免疫沈降)があります。

転写因子とプロモーターについて 削除/引用
No.6409-1 - 2017/10/24 (火) 11:00:24 - fukurou
質問が三つあります。

1転写因子とは転写調節因子と同じものを指すのでしょうか?

2転写因子とはエンハンサーやサイレンサーといったものという解釈でいいのでしょうか?

3転写因子とプロモーターが結合しているかをどのように判別できるでしょうか?


知識不足ですいませんが解答のほうよろしくお願いします。

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