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ハウスキーピングHPRT遺伝子の影響on雌雄差
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No.6408-TOPIC - 2017/10/23 (月) 03:08:37 - はうす
質問させてください。
ハウスキーピング遺伝子のHPRTを使ってこれまで人のとある遺伝子Xの発現解析をしてきた方がいます。ある遺伝子Xに関して変異のない家族を解析していても、ある遺伝子Xの発現に雌雄差が現れたようです。
具体的には男性で1とした場合、女性では0.5となったようです。
HPRTはX染色体に乗っているので、これを使って雌雄を混同したサンプルを解析しない方がよい、と先輩から教わっていたので、ひょっとして、あの方の不思議なデータは、雌雄感のHPRTの差を反映しているだけなのではと思っています。
女性の場合、X染色体は2つあります。もちろんX染色体不活化はありますが、みなさんは雌雄混同したサンプルを扱うような場合、HPRTを使ってqPCRを行ったりしますか?
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No.6408-4 - 2017/11/02 (木) 19:42:30 - MTP
ハウスキーピング遺伝子に関してはここでも多くのトピックが上がっていますが、Actb, Rplp0, Gapdh, Hprtなどの有名なものから2つ以上選んで用いるべきです。
少し手間は増えますがそれだけで後の解析での不安材料を無くせるのですから。
(無題)
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No.6408-3 - 2017/10/25 (水) 14:44:41 - おお
ちょっと検索するとMale-femaleかんでインターナルコントロールの比較をしたりしている文献も出てくるのでいくつか読み漁ればどうでしょうか?私もちょっと検索しましたが、まとめれるほど余裕がありませんので。
(無題)
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No.6408-2 - 2017/10/25 (水) 13:23:41 - あのう
よくわからんけど、HPRTじゃなくてactinにしたら解決っしょ。
ハウスキーピングHPRT遺伝子の影響on雌雄差
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No.6408-1 - 2017/10/23 (月) 03:08:37 - はうす
質問させてください。
ハウスキーピング遺伝子のHPRTを使ってこれまで人のとある遺伝子Xの発現解析をしてきた方がいます。ある遺伝子Xに関して変異のない家族を解析していても、ある遺伝子Xの発現に雌雄差が現れたようです。
具体的には男性で1とした場合、女性では0.5となったようです。
HPRTはX染色体に乗っているので、これを使って雌雄を混同したサンプルを解析しない方がよい、と先輩から教わっていたので、ひょっとして、あの方の不思議なデータは、雌雄感のHPRTの差を反映しているだけなのではと思っています。
女性の場合、X染色体は2つあります。もちろんX染色体不活化はありますが、みなさんは雌雄混同したサンプルを扱うような場合、HPRTを使ってqPCRを行ったりしますか?
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