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(無題) 削除/引用 No.6405-6 - 2017/10/22 (日) 13:25:36 - mon 組換え酵素反応の前後で配列がどうなるか（連結するか否か、連結するにはどうなるべきか）は、切断部位付近の配列から制限酵素の様に考えることも可能です。 Cre結合部位(正方向) 組換え部位 (^は切断部位) Cre結合部位（逆方向） 5'-ATAACTTCGTATA - G^ATACA T - TATACGAAGTTAT -3' 3'-TATTGAAGCATAT - C TATGT^A - ATATGCTTCAATA -5' なので、反応中間体に制限酵素切断断片のような5’突出部位（一本鎖5'-TGTAT-3'）が出来ますので、そこが相補的なら連結されます。 上記組換え部位(5’突出部位)の配列が異なるため、loxPとは組換えが生じないlox511, lox5117, lox2272, loxFASも汎用されます。

(無題) 削除/引用 No.6405-5 - 2017/10/22 (日) 07:52:55 - おお 左向きloxP-STOP-左向きloxP-GFPこれの相補鎖をみると、GFP（-鎖）-右向きloxP-STOP（-鎖）-右向きloxPですよねと申し上げています。右向きloxP-STOP-右向きloxPはどうなるんですか？

(無題) 削除/引用 No.6405-4 - 2017/10/21 (土) 20:21:24 - Cre-loxP 文字化けしてますね、申し訳ございません。 1.右向きloxP-STOP-右向きloxP-GFP 2. 左向きloxP-STOP-左向きloxP-GFP

(無題) 削除/引用 No.6405-3 - 2017/10/21 (土) 20:04:09 - Cre-loxP ▶=loxP（右向き） 1. ▶-STOP-▶GFP 2. ◀-STOP-◀-GFP Creが発現すると1, 2共にloxP-GFPしか残ら無い、すなわちこの場合loxPの配列は右向きであろうと左向きであろうと関係なく、どちらでも良いということでよろしいでしょうか？

(無題) 削除/引用 No.6405-2 - 2017/10/21 (土) 19:31:23 - おお 同じ方向にLoxPが並んでたらその間が飛ぶということ。例えば両方とも相補的な配列があると言うけど、１８０度ひっくり返せばLoxPの間にGFPの相補的な配列が入っていると見てもいいわけだし。 片方だけ相補的な配列がある場合は話が違ってきます。 https://www.jax.org/news-and-insights/2006/may/the-cre-lox-and-flp-frt-systems

loxP配列の向きについて 削除/引用 No.6405-1 - 2017/10/21 (土) 17:57:59 - Cre-loxP いつもお世話になっております。 Cre-loxPシステムで質問なのですが、 loxPサイトの配列は以下のような配列であることが知られているかと思います。ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT Creが存在すると、loxP-STOP-loxP-GFP配列はloxP-GFPとなるかと思いますが、 もし仮にATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATの相補鎖配列で同様にloxP-STOP-loxP-GFPとなっていた場合、Creによってリコンビネーションが起こると、同様にloxP-GFPの配列になるのでしょうか？ 説明が下手くそで申し訳ありません。よろしくお願いします。

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