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(無題) 削除/引用 No.6391-3 - 2017/10/18 (水) 23:20:17 - 橘 まず、ゲノムプロジェクトをBioProjectに登録する。BioProjectの概要と登録方法はBioProject Handbook参照。 次に、解読したサンプルに関する情報をBioSampleに登録する。これもBioSample Handbookを参照して下さい。 配列データは、NGS生データをDDBJ Sequence Read Archiveに登録し、アセンブリはその完成度によってWGSまたはCONとしてMass Submission Systemにより登録する。 Scaffoldが40というのは、ミスアセンブルでないのなら素晴らしい完成度ですから、遺伝子予測データも入っていれば大歓迎されると思います。遺伝子予測データがないなら、中の人に相談してもいいでしょうし、配列が公開されれば誰かがやってくれるかもしれません。

(無題) 削除/引用 No.6391-2 - 2017/10/18 (水) 15:04:11 - moz ddbjの担当者に質問した方が二度手間が省けますよ。

ドラフトゲノム配列登録 削除/引用 No.6391-1 - 2017/10/16 (月) 20:07:48 - draft illuminaであるカビのドラフトゲノム配列を解析して、 アッセンブリして約40のscaffoldからなるfastaデータがあるのですが、 これをddbj/genebank/emblに登録する方法をご存じでしたらご教示願います。 �@ddbjでは配列毎に配列修了フラグを入れないといけないとのことですが、 2万個配列に終了フラグを手入力しない方法はあるでしょうか？ �A送付するアノテーションファイルはどのように作成しているのでしょうか？ よろしくお願い致します。

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