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(無題) 削除/引用 No.63-3 - 2012/01/23 (月) 18:18:01 - bbbs >橘様 FASTAを入れて少し使ってみました。いまいち使い方が分からないので、Webや書籍でもうすこし勉強してみます。FASTAの利用法で、参考となるものがございましたらご教示ください。ご助言ありがとうございました。 また、FASTA以外のツールについてもご存じの方がいらっしゃいましたら、ご教示ください。よろしくお願いします。

FASTA 削除/引用 No.63-2 - 2012/01/22 (日) 22:22:57 - 橘 FASTAでできるはずですが。 Windows版バイナリとUNIX環境用ソースコードが http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_down.shtml から配布されてますので、そこから落として入れて、 fasta36 query.fasta subject.fasta とかやってみてはどうですか。

特殊な(?)アラインメント 削除/引用 No.63-1 - 2012/01/20 (金) 23:25:14 - bbbs 5~8b程度の配列に似た領域を、ある領域(2kb)から複数抽出したいと考えています。ClustalWを用いると、最も相同した１配列のみが抽出されてしまい、複数の領域を取り出そうとすると煩雑な作業になってしまいます。 大きな配列中から似た配列を同時に複数抽出できるようないい方法は無いでしょうか。

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