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コンピテントセルのCFUについて
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No.6263-TOPIC - 2017/08/31 (木) 13:32:39 -
CFU
コンピテントセルを自作してみてCFUを計算したところ、5 x 10^6 cfu/μgでした。皆さんは普段どれくらいのCFUのコンピテントセルを使っていますか?
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No.6263-5 - 2017/09/02 (土) 07:53:11 -
m
18度で培養する方法が良いです。
出来立てで10の8乗が目標。ー80度保存。(液体窒素を買う金ありません。)
7乗以下は数ヶ月でダメになります。
ライゲーションはタカラのキット。
インサート1 ul, ベクター0.5 ul, 試薬1.5 ulでやってます。
(無題)
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No.6263-4 - 2017/08/31 (木) 17:28:19 - AP
どこかのテクニカルチップの論文だったか記事だったかで、手抜き形質転換法が紹介されていて、
スモールスケールのO/NカルチャーにCaCl2だったかを加えただけの菌液にライゲーション産物やプラスミドを入れるというのがあった。形質転換効率はかなり低かったと思うがサブクローニングくらいならそれでもいけるってこと。
(無題)
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No.6263-3 - 2017/08/31 (木) 17:24:31 - AP
作った直後で10^8 cfu/ug くらい
それをディープフリーザーで保存したもので、時には数年たったものを普段は使っているので1,2ケタオチだと思う。
作った直後で10^6は低いかもしれないけれど使えないレベルじゃないだろう。
形質転換効率を調べるときは、プラスミド量が多過ぎるとcfuとの線形性が無くなる(プラスミドを増やしたほどにはコロニーが増えない)ので、1 ng以下のプラスミドでみるのがいいと思う。
(無題)
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No.6263-2 - 2017/08/31 (木) 15:26:06 - おお
10^6〜10^7
昔ながらのフラグメントをプラスミドにライゲーションしてという作業なら、10^6ぐらいならよほど難しいもの出ない限り許容範囲。もちろん高ければ高いほうがいいです。
コンピテントセルのCFUについて
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No.6263-1 - 2017/08/31 (木) 13:32:39 -
CFU
コンピテントセルを自作してみてCFUを計算したところ、5 x 10^6 cfu/μgでした。皆さんは普段どれくらいのCFUのコンピテントセルを使っていますか?
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