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マウス由来の細胞株の同定について トピック削除
No.6165-TOPIC - 2017/07/29 (土) 12:29:31 - まつたけ
学部生なのですが、マウス由来の細胞株の同定について質問があります。
ヒト由来と思って使っていた細胞が実はマウス由来の細胞株であったことが先日分かりました。
そこで、この細胞がマウスの何の細胞か知りたいと思い、調べてみたところ、ヒト由来の細胞株ならSTR解析を行っている業者が見つかったのですが、マウスの細胞株で同様の解析を行っているところは見つかりませんでした。
自分の調べ方が不十分なのかもしれませんが、マウス由来の細胞株の同定について、何か知っているかたがいらっしゃれば、教えていただきたいです。
ちなみに、使用している細胞がマウス由来のものであることは、RT-PCRでGAPDHを解析することで確かめました。
 
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(無題) 削除/引用
No.6165-3 - 2017/07/30 (日) 19:35:56 - KSR
>ちなみに、使用している細胞がマウス由来のものであることは、RT-PCRでGAPDH
>を解析することで確かめました。

貴方のメンターや指導教官も同じ意見ですか?
マウスプライマーのRT-PCRの結果だけでは、
正直根拠が弱いと思います。
STEM121やLamin A/Cのようなヒト特異的抗体で染まりませんか?
あるいはゲノムのPCRで調べる方法もあります。
http://cell.brc.riken.jp/ja/quality/pcr

使用されている細胞はラボの先輩がストックしたものですか?
細胞株を同定するのであれば、解析を外注するよりも、
貴方のラボの細胞の使用履歴を洗って、
取り違え、コンタミした可能性のある
マウスの細胞をリストアップしたほうが良いのでは。

また、得体の知れないサンプルの同定に無駄な時間とお金を使うくらいなら、
とっとと廃棄してセルバンク等からきちんとした細胞を入手して、
自分の実験を進めたほうが生産的だと思います。

(無題) 削除/引用
No.6165-2 - 2017/07/29 (土) 16:55:38 - AP
詳しいわけではないんですが
マウス細胞株は近交系から作られているため、細胞株の同定は困難で、由来マウス系統を同定するのが限度のようです。
http://jcrbcelldata.nibiohn.go.jp/str/cell_line_authentication

理研Cell Bankでおこなわれている、SSLPによる由来マウス系統の検査法が公開されています。
http://cell.brc.riken.jp/ja/quality/sslp

マウス由来の細胞株の同定について 削除/引用
No.6165-1 - 2017/07/29 (土) 12:29:31 - まつたけ
学部生なのですが、マウス由来の細胞株の同定について質問があります。
ヒト由来と思って使っていた細胞が実はマウス由来の細胞株であったことが先日分かりました。
そこで、この細胞がマウスの何の細胞か知りたいと思い、調べてみたところ、ヒト由来の細胞株ならSTR解析を行っている業者が見つかったのですが、マウスの細胞株で同様の解析を行っているところは見つかりませんでした。
自分の調べ方が不十分なのかもしれませんが、マウス由来の細胞株の同定について、何か知っているかたがいらっしゃれば、教えていただきたいです。
ちなみに、使用している細胞がマウス由来のものであることは、RT-PCRでGAPDHを解析することで確かめました。

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