Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

Image Jによる蛍光画像解析 トピック削除
No.6147-TOPIC - 2017/07/22 (土) 05:29:58 - SS-F
いつも参考にさせて頂いています。今回、Image Jによる蛍光画像の解析について伺いたく書き込みをさせて頂きました。

現在、マウス皮下移植腫瘍を用いた研究を進めています。先日治療の有無による癌細胞の変化を見るために組織切片を作成したのですが、現在の腫瘍は浸潤細胞が多く、特に治療群では癌細胞の姿がIHCでは曖昧になってしまいました。そこで、癌細胞マーカーも加えた多重蛍光染色で変化をはっきりさせようと考えています(一例としては、癌マーカーとKi67、DAPIの3重染色などです)。
Image Jが使えるかと思いますが、これまでIHCの定量しか実施したことがなく、蛍光画像の癌細胞マーカーのチャンネルから陽性領域をゲーティングし、その中における別チャンネルの標的分子の陽性細胞数を定量する方法をどなたかご存じでないでしょうか。

本来はFlow cytometryが一番早い手法とは思いますが、細胞数に限りがあること、かつまずは種々の変化から当たりをつけるため切片での観察を進めています。

どうぞよろしくお願いします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


Image Jによる蛍光画像解析 削除/引用
No.6147-4 - 2017/07/24 (月) 22:59:49 - SS-F
>ふむふむさん
ありがとうございます。このソフトは知りませんでしたがIHCの定量では便利ですね。使ってみましたが、蛍光はまだカウントがオートではいかないようなのですが、そこが使えればインターフェイスも使いやすいので有用ですね。

>emaさん
ありがとうございます。Image Jで画像を各チャンネル別に切り替えながら目的領域のみをくくり、スタック画像のまま新ファイルを作る方法がわかったので、そこからチャンネル分けしてAnalysis particleでそれぞれオートカウントをしてみようかと思います。

どうもありがとうございました。

日本語のページ 削除/引用
No.6147-3 - 2017/07/24 (月) 15:44:18 - ema
チャンネル分けが出来れば、あとは単色と一緒です。
https://lpixel.net/download/141003-0915.pdf
https://www.slideshare.net/atsutoonoda/image-j-52335489

(無題) 削除/引用
No.6147-2 - 2017/07/24 (月) 11:21:18 - ふむふむ
http://forum.imagej.net/t/counting-double-labeled-cells-in-fiji/3832

Image Jによる蛍光画像解析 削除/引用
No.6147-1 - 2017/07/22 (土) 05:29:58 - SS-F
いつも参考にさせて頂いています。今回、Image Jによる蛍光画像の解析について伺いたく書き込みをさせて頂きました。

現在、マウス皮下移植腫瘍を用いた研究を進めています。先日治療の有無による癌細胞の変化を見るために組織切片を作成したのですが、現在の腫瘍は浸潤細胞が多く、特に治療群では癌細胞の姿がIHCでは曖昧になってしまいました。そこで、癌細胞マーカーも加えた多重蛍光染色で変化をはっきりさせようと考えています(一例としては、癌マーカーとKi67、DAPIの3重染色などです)。
Image Jが使えるかと思いますが、これまでIHCの定量しか実施したことがなく、蛍光画像の癌細胞マーカーのチャンネルから陽性領域をゲーティングし、その中における別チャンネルの標的分子の陽性細胞数を定量する方法をどなたかご存じでないでしょうか。

本来はFlow cytometryが一番早い手法とは思いますが、細胞数に限りがあること、かつまずは種々の変化から当たりをつけるため切片での観察を進めています。

どうぞよろしくお願いします。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。