Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

ミトコンドリア分画のWestern blot トピック削除
No.6136-TOPIC - 2017/07/19 (水) 12:20:04 - 名無し
平素より大変お世話になっております。

マウス骨格筋のミトコンドリアを等密度勾配遠心法にて抽出したあと、
Western blotでミトコンドリア外膜に局在するタンパクの定量を試みています。

しかし、想定されるバンド付近には点のようなものしか検出されず、バンドの形を形成していません。
凝集している可能性を考えて、シリンジを通すなどを行ったのですが、改善が認められない状況です。
しかし、ターゲットとしているタンパク以外は通常のバンドと同じように検出することができます。

原因が全く特定することができず、とても困っています。
もしこれまでに、このようなご経験のある方がいらっしゃいましたら、ご助言を頂戴できないでしょうか。
何卒宜しくお願い致します。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.6136-5 - 2017/07/19 (水) 16:52:16 - 名無し
AP様>
有難うございます。
これまでに、別サンプル(等密度勾配遠心分離前のWhole lysate、C2C12のWhole lysate)を用いて抗体は標的を認識すること、
また、同じ実験を複数回行って同様の結果が出たことから、
今回見られた点はノイズではないと考えております。


おお様>
大変貴重なご指摘を有難うございます。
分子量は他のサンプルでみられる大きさと変わらないため、
おお様の仰る通り、凝集している訳ではないかもしれません。
ご助言に従いまして、希釈したものを流し、条件検討を行ってみたいと思います。


み様>
有難うございます。
ポジコンにTotal lysateを加え、原因を追究したいと思います。
ご指摘を大変感謝致します。

(無題) 削除/引用
No.6136-4 - 2017/07/19 (水) 15:12:57 - み
密度勾配を経ずに得たtotal lysateをポジコンにして、抗体の評価と流しているサンプルの評価を区別しないとね。

(無題) 削除/引用
No.6136-3 - 2017/07/19 (水) 14:16:20 - おお
バンドの形状が点になるのと、凝集しているのは別問題だと思います。凝集してたら分子量が大きく(大抵の場合かなり大きく)見積もられる位置に来ると思います。他の検出しているバンドに比べてかなり分子量が高いとかないでしょうか?バファーや夾雑物の影響でバンドが細くなったり(そういう場合は末広がりだったりして下の方のバンドはマシに見えたりする)、そんなことが関係してそうな気がします。検出にあまり大きな影響がないなら 1xSample Bufferで4倍ぐらいに希釈して4分の1量とか流すとどうでしょうか。流れた様子はMembraneに移してからPonceauなどで染めるとわかります。

(無題) 削除/引用
No.6136-2 - 2017/07/19 (水) 14:15:16 - AP
その抗体はちゃんと標的を検出できるのだろうか?
そうではなくて、たまたまその辺りにドット状のノイズが見えてるだけの可能性は?

ミトコンドリア分画のWestern blot 削除/引用
No.6136-1 - 2017/07/19 (水) 12:20:04 - 名無し
平素より大変お世話になっております。

マウス骨格筋のミトコンドリアを等密度勾配遠心法にて抽出したあと、
Western blotでミトコンドリア外膜に局在するタンパクの定量を試みています。

しかし、想定されるバンド付近には点のようなものしか検出されず、バンドの形を形成していません。
凝集している可能性を考えて、シリンジを通すなどを行ったのですが、改善が認められない状況です。
しかし、ターゲットとしているタンパク以外は通常のバンドと同じように検出することができます。

原因が全く特定することができず、とても困っています。
もしこれまでに、このようなご経験のある方がいらっしゃいましたら、ご助言を頂戴できないでしょうか。
何卒宜しくお願い致します。

5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。