Bio Technical フォーラム

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FBS中のタンパク質 トピック削除
No.6082-TOPIC - 2017/06/29 (木) 14:18:17 - かえる
今アミロイドベータの検出をウェスタンブロットで試みているものです。


アミロイドベータを検出する抗体を三種類使用したのですが、いずれもアミロイドベータがあるはずの場所(4.4kDa)に検出されず、それよりも上の場所(8-10kDa)にバンドがでます。
アミロイドベータペプチドのみを検出すると、そのバンドもないのですが、FBSに含まれるタンパク質で、アミロイドベータと同じような配列をもつタンパク質は存在するのでしょうか。

どなたか、それぐらいのサイズのタンパク質をご存知の方はいらっしゃいますか?
 
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(無題) 削除/引用
No.6082-3 - 2017/07/02 (日) 09:16:47 - おお
8-10kDaというのは非常に小さいので、分子量として正確に認識できているかどうか。

ダイマーとかも検出されたりするようで、変性条件とかどの程度気を使わなければならないか?

合成ペプチドからのアミロイドであれば、しっかりした編成条件下では、酸化などのクロスリンクがなければ4kDaに出て来るであろうけど、APPからできるものであればもっとクルードな分子構成になっている可能性もあると思う。

あとリン酸化などもあるみたいだなぁ。

3種類の抗体で出ているので(違うメーカーから買ったけど同じクローンとか言うことがなければ)、テクニカルに問題がなければ確実だろうけど、牛もAPPは持ってるよね。この辺はプラクティカルにどうなのかわからないですが、ノンスペであっても、牛由来の蛋白であってもネガコンがあればある程度のことは言えるのでは?培地からの検出をしているなら、フレッシュな培地とか使ってみるとか。

(無題) 削除/引用
No.6082-2 - 2017/06/30 (金) 15:50:35 - mon
FBS由来の根拠はありますか?
例えば、ネガコンとなるFBSのみを隣のレーンに一緒に流せば、8-10kDaのバンドがFBS由来か否か判るのでは。。
余分な(予想外の)バンドがWBで検出された場合、抗体の特異性の検証は特に必須ですよ。。

FBS中のタンパク質 削除/引用
No.6082-1 - 2017/06/29 (木) 14:18:17 - かえる
今アミロイドベータの検出をウェスタンブロットで試みているものです。


アミロイドベータを検出する抗体を三種類使用したのですが、いずれもアミロイドベータがあるはずの場所(4.4kDa)に検出されず、それよりも上の場所(8-10kDa)にバンドがでます。
アミロイドベータペプチドのみを検出すると、そのバンドもないのですが、FBSに含まれるタンパク質で、アミロイドベータと同じような配列をもつタンパク質は存在するのでしょうか。

どなたか、それぐらいのサイズのタンパク質をご存知の方はいらっしゃいますか?

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