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売られているHis-tag付きのタンパク質のスペーサー配列について
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No.608-TOPIC - 2012/06/05 (火) 20:24:51 -
くー
購入可能なHis-tag付きのタンパク質をいろいろ調べていましたら、配列の始まりが、
MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHで始まるものがたくさんありました。
(例)
Human Vaspin, aa 21-414
http://www.biocompare.com/10204-Biomolecule/437730-Human-Vaspin-aa-21414-His-ConjugatedTagged/
AK2 protein
http://www.abcam.com/AK2-protein-His-tag-ab78832.html
など
Mは翻訳開始のメチオニン
HHHHHHはHis-tag
GSSとSSGLVPRGSHはスペーサーなのかなと。
スペーサーの役割としては、His-tagとタンパク質の間を空けることで、タンパク質の中に埋もれさせないようにするためですよね。。。埋もれてしまったら、Ni-NTAで精製できないと。。。
そこで、なぜこのスペーサーになったのかと気になりました。
誰かが、実験でこのような配列に決定したのでしょうか?
それとも、天然にあるものを真似てやったものなのでしょうか?
細かいことですが、何かわかる方よろしくお願い致します。
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(無題)
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No.608-5 - 2012/06/06 (水) 08:14:48 - ab
発現させるベクターが同じだからではないでしょうか。
メーカーによってスペーサーの配列は異なるようですが。
(無題)
削除/引用
No.608-4 - 2012/06/06 (水) 03:10:42 - th
LVPR GS: thrombin cleavage site
(無題)
削除/引用
No.608-3 - 2012/06/05 (火) 21:57:41 -
qq
thrombinやF-Xaの切断部位だったりしませんか?
(無題)
削除/引用
No.608-2 - 2012/06/05 (火) 21:30:55 - 直輝
スペーサーの部分がクローニングサイトを兼ねていて、制限酵素サイトが並んでいるんじゃないかな。
売られているHis-tag付きのタンパク質のスペーサー配列について
削除/引用
No.608-1 - 2012/06/05 (火) 20:24:51 -
くー
購入可能なHis-tag付きのタンパク質をいろいろ調べていましたら、配列の始まりが、
MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHで始まるものがたくさんありました。
(例)
Human Vaspin, aa 21-414
http://www.biocompare.com/10204-Biomolecule/437730-Human-Vaspin-aa-21414-His-ConjugatedTagged/
AK2 protein
http://www.abcam.com/AK2-protein-His-tag-ab78832.html
など
Mは翻訳開始のメチオニン
HHHHHHはHis-tag
GSSとSSGLVPRGSHはスペーサーなのかなと。
スペーサーの役割としては、His-tagとタンパク質の間を空けることで、タンパク質の中に埋もれさせないようにするためですよね。。。埋もれてしまったら、Ni-NTAで精製できないと。。。
そこで、なぜこのスペーサーになったのかと気になりました。
誰かが、実験でこのような配列に決定したのでしょうか?
それとも、天然にあるものを真似てやったものなのでしょうか?
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