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タンパク質のタグについて トピック削除
No.6060-TOPIC - 2017/06/19 (月) 02:56:15 - ふみ
学部生でまだ知識が浅いので、失礼がありましたらすいません。

相互作用しているタンパク質を泳動した際に、サンプルバッファーで処理した後に、タグは切れないのに、相互作用は外れてしまうのはなぜなのでしょうか。単純な結合の力の差なのでしょうか?教えていただきたいです。
 
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(無題) 削除/引用
No.6060-3 - 2017/06/19 (月) 12:19:29 - おお
まず、どのようにしてタグつきのタンパク質が合成されるのでしょうか?
タグが外れるという理屈が正しいとしたら、Domain AとBをもつタンパク質は、Domain AとBに別れてしまいます。あるいはDomain Aの真ん中で別れてしまっても不思議でありませんよ。特別の場合をのぞいた一般則でお考えください。


単純な結合の力の差なのでしょうか?
分子間相互作用と分子内の原子間の相互作用の違いです。

(無題) 削除/引用
No.6060-2 - 2017/06/19 (月) 04:13:19 - iPSC
タグはペプチド結合で目的のタンパク質に連結されているだけですよね。相互作用するタンパク質は立体構造等に起因していると思いますが、SDS等の変性剤を含むsampleバッファーはタンパク質を線状にします。故に立体構造を保持できなくなり、相互作用するたんぱく質との結合は解離してしまいます。

ですが、タグの場合、ペプチド結合でタンパク質に連結しているだけですので、その場合には立体構造云々は関係ないということになります。

タンパク質のタグについて 削除/引用
No.6060-1 - 2017/06/19 (月) 02:56:15 - ふみ
学部生でまだ知識が浅いので、失礼がありましたらすいません。

相互作用しているタンパク質を泳動した際に、サンプルバッファーで処理した後に、タグは切れないのに、相互作用は外れてしまうのはなぜなのでしょうか。単純な結合の力の差なのでしょうか?教えていただきたいです。

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