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FLAG-cDNAを導入した細胞のWBで非特異的なバンドがでる トピック削除
No.6052-TOPIC - 2017/06/15 (木) 11:43:40 - 非特異的な人間
すみません、ウエスタンブロットの結果で質問させて下さい。
FLAGタグを付けたcDNA発現ベクターを培養細胞にトランスフェクトしてWBをしました。
FLAG抗体で検出した結果、目的のサイズのバンドがでたのですが、それ以外にもサイズの異なるバンドが2本(目的のサイズより高いバンドと低いバンド)現れました。
No transfectの細胞や、FLAG-emptyをtransfectした細胞では、これらのバンドが全く出てきませんでした。
この2本の非特異的なバンドが何なのかわかりません。
目的のタンパク質が高次構造を作って、サイズの異なるバンドがでてくるものなのでしょうか?
どのように解釈してよいかわからないので、質問しました。
 
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(無題) 削除/引用
No.6052-3 - 2017/06/15 (木) 14:16:49 - 非特異的な人間
SDS-PAGEの原理を復習すると、確かに高次構造を検出しないような処理をしてますね。勉強になりました。
非特異的ではなく、特異的なバンドと考えればよいのですね。

オーバーロードすると、複数のバンドが検出される場合もある点があるんですね。
なぜそうなるのか、理由が気になりました。

(無題) 削除/引用
No.6052-2 - 2017/06/15 (木) 12:17:18 - おお
多分特異的なバンドでしょう。SDS-PAGEの原理を復習してください。高次構造が検出できるかどうかよく考えてみてください。移動度が変わる原因は他にもいっぱいあります。例えば短くなっちゃったら小さいものが検出されますよね。コバレントに何かくっついたらどうですか?加えて電荷によって蛋白が流れているわけですよね。

またもしオーバーロードならシングルバンドで出るはずのものが、複数になったりすることはあります。

FLAG-cDNAを導入した細胞のWBで非特異的なバンドがでる 削除/引用
No.6052-1 - 2017/06/15 (木) 11:43:40 - 非特異的な人間
すみません、ウエスタンブロットの結果で質問させて下さい。
FLAGタグを付けたcDNA発現ベクターを培養細胞にトランスフェクトしてWBをしました。
FLAG抗体で検出した結果、目的のサイズのバンドがでたのですが、それ以外にもサイズの異なるバンドが2本(目的のサイズより高いバンドと低いバンド)現れました。
No transfectの細胞や、FLAG-emptyをtransfectした細胞では、これらのバンドが全く出てきませんでした。
この2本の非特異的なバンドが何なのかわかりません。
目的のタンパク質が高次構造を作って、サイズの異なるバンドがでてくるものなのでしょうか?
どのように解釈してよいかわからないので、質問しました。

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