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(無題) 削除/引用 No.6015-3 - 2017/06/04 (日) 08:55:03 - mon 塩基配列の確定度は高いと思いますが、染色体へMapされていないなどを考えるとdraft genome sequenceでしょう。すなわち「draft genomeを解析した」のは間違いないですが、whole genome解析ではないですね。 それを用いて、おそらくexon-intron構造等を解析して、ある遺伝性疾患の原因変異（の候補）を同定したという報告になるのでしょう。もしかしたら残ったSequence Gap中に原因変異が隠れているかもしれないので、確定はできないでしょう。 ただし、変異型cDNAを（in vitroで）発現させてタンパク機能解析等を行っているのであれば、「ほぼ」同定で良いかもしれません。 draft genome sequenceの質を示すために、contig(scaffold)長と頻度（＋平均値・中央値があるバーを示すなど）のグラフなどをいれても良いでしょう。

(無題) 削除/引用 No.6015-2 - 2017/06/04 (日) 08:36:59 - おお draft genomeに明確な定義があるかどうかはわかりません。あれば読んでいる人に指摘していただきたいのですが、あなたの論文のMethodsで方法などをきっちり書いた上で、そのようにdraft genomeを得た、構築したなどと書けばいいのではないでしょうか。精度に関するなど各種パラメーターも（といっても私は詳しくないのでわからいませんが）結果として明示しておくといいでしょうk。

draft genomeの定義 削除/引用 No.6015-1 - 2017/06/03 (土) 09:51:06 - omi ほぼデータを出し終えまして、論文執筆を行っています。 ある哺乳類のdraft genomeをde novoに作成して、その哺乳類の変わった遺伝性疾患を明らかにしました。 Solid sequencerでx100以上になるようにラフに読みましたが、予算が限られていたため、ゲノム解析としては、まだまだ精度が低い状態です。scaffold長も全体的に短く、ゲノムサイズの推定にも至っていません。 しかし配列自体はかなりのcover数で読んでいるのは確かですし、公表はする予定です。 この状況で、論文中でdraft genomeを解析したと言い切ってもいいのでしょうか？ 様々な文献を見ましたが、定義がはっきりしません。

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