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DNAシークエンス(sequence)解析用ソフト
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No.589-TOPIC - 2012/05/30 (水) 14:20:10 -
匿名
はじめて利用します。
ある遺伝子のPCR産物を、シーケンスして、Ab1.ファイルを得ました。
ある塩基がホモかへテロかを判断しようとした場合、そこの波形が、二種類の塩基の波で構成されていて、且つ、その高さが同じである、ということで間違っていませんか。
また、フリーのソフトで、シーケンスの結果と、標準の塩基配列とを比較したり、ホモかへテロかを判断するようなものはありませんでしょうか。
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No.589-5 - 2012/06/08 (金) 20:20:00 - 匿名
みなさま、ありがとうございました。たすかりました。
http://www.appliedbiosystems.jp/website/jp/product/modelpage.jsp?BUCD=130&PLCD=128&MODELCD=66272&MODELPGCD=115723
SeqScape® ソフトウェア ver2.5デモソフトウェア (インストールから45日間有効)
上記を使うことにしました。デモソフトでも、どこにヘテロがあるか、一目でわかる表示があり、つかいやすいです。
(無題)
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No.589-4 - 2012/06/02 (土) 08:32:10 - AP
http://www.molgen.ua.ac.be/bioinfo/novosnp/
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1532046409001506
(無題)
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No.589-2 - 2012/06/01 (金) 22:48:55 - toku
このソフトとかいろいろ出来そうです。
www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html
www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/screenshots.html
DNAシークエンス(sequence)解析用ソフト
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No.589-1 - 2012/05/30 (水) 14:20:10 -
匿名
はじめて利用します。
ある遺伝子のPCR産物を、シーケンスして、Ab1.ファイルを得ました。
ある塩基がホモかへテロかを判断しようとした場合、そこの波形が、二種類の塩基の波で構成されていて、且つ、その高さが同じである、ということで間違っていませんか。
また、フリーのソフトで、シーケンスの結果と、標準の塩基配列とを比較したり、ホモかへテロかを判断するようなものはありませんでしょうか。
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