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次世代シーケンスのコストについて トピック削除
No.5772-TOPIC - 2017/02/20 (月) 10:43:57 - ゆうた
ライブラリー調整済みのヒト由来DNAの塩基配列を読みたく思っています。
PE150で5000万read予定で、数社に外注の見積を取りました。
検体数は約200件あるのですが、おおよそ1000万円程度との返答です。

外注する分マージンを取られるのは理解していますが、ここまで高額になるものなのでしょうか?
初歩的な質問で恐縮ですが、ご教授いただけると幸いです。
よろしくお願いいたします。
 
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No.5772-7 - 2017/02/20 (月) 13:44:48 - ゆうた
みなさん、貴重な情報ありがとうございます。
かなり良心的な価格だったのですね。

見積いただいた金額で価格申請しようと思います。
改めて、お世話になりました。

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No.5772-6 - 2017/02/20 (月) 13:40:36 - おお
>1検体5万円
この数字を見ると格安って感じがしますね。

(無題) 削除/引用
No.5772-5 - 2017/02/20 (月) 13:29:46 - AP
1検体5万円なら、ライブラリー作成のあとに必要な消耗品を個別に購入したら軽く超えるね。プロバイダは大量仕入れで仕切り値を下げたりして人件費や儲けを出してるんだと思うけど。一件200検体というバッチの発注なのでコストが下げられるからこそのその価格だと思います。1検体とか数検体とか小口なら普通はその数倍かかると思う。

(無題) 削除/引用
No.5772-4 - 2017/02/20 (月) 12:51:43 - CD
Hiseq2000を使うとして1フローセル当たり20億リードだとすると流せるサンプルが40なので5枚はフローセルが必要。。。 解析込みだったりすれば1000万て割と妥当なのでは?というか良心的。。。

(無題) 削除/引用
No.5772-3 - 2017/02/20 (月) 11:45:58 - toto
200検体だとそれくらいがいいお値段じゃないでしょうか。1検体5万ですよね。そこまでかけたくない場合は、マシンを持ってるところとの共同研究を頼み込む手も、興味が合うところが見つかれば現実的かもしれません。

(無題) 削除/引用
No.5772-2 - 2017/02/20 (月) 11:37:37 - mon
会社の儲けを考えると、必要な消耗品費の5~10倍くらいは妥当でしょう。
ご自分で必要な消耗品費を計算すると良いと思います。
機器費(購入+メンテナンス:結構高価で年間費が購入費の1/5程度は普通)、人件費(トレーニング費+実働時間+福利厚生)+消耗品費(購入、保存費、廃棄費、廃棄率)などは最低かかりますので。
そのため、アメリカや中国など稼働率の高い企業や大学・公的機関などの共利研(稼働率を上げるため外注を受ける所があります)などを探すと良いかもしれません。ただし素データを受け取るだけで(あなたが求める)最後までの解析はご自分で行う必要があるかもしれません。

次世代シーケンスのコストについて 削除/引用
No.5772-1 - 2017/02/20 (月) 10:43:57 - ゆうた
ライブラリー調整済みのヒト由来DNAの塩基配列を読みたく思っています。
PE150で5000万read予定で、数社に外注の見積を取りました。
検体数は約200件あるのですが、おおよそ1000万円程度との返答です。

外注する分マージンを取られるのは理解していますが、ここまで高額になるものなのでしょうか?
初歩的な質問で恐縮ですが、ご教授いただけると幸いです。
よろしくお願いいたします。

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