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インサートが長いプラスミドの全長をシークエンス解析するには? トピック削除
No.575-TOPIC - 2012/05/27 (日) 17:37:29 - 初心者
サブクローニングしたプラスミドを、ユニバーサルプライマー (SP6とT7) を用いて5'側と3'側から配列を読みました。しかし、インサートの配列が長くて、真ん中部分の配列が読めません。インサートの配列の全長をシークエンスで読みたい場合、どのような方法を用いればよいでしょうか? シーケンス解析は、企業の受託サービスを利用しています。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.575-4 - 2012/07/31 (火) 09:33:46 - 初心者
ご解答ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.575-3 - 2012/05/28 (月) 08:48:22 - ~
その委託先企業に状況を伝え、希望する結果が得られていないと伝える。
対応策が提案されなかったら、別の企業に委託することにする。

インサートの長さによっては、今読めている配列からデザインしたプライマーでも届かないかもしれません。
要求事項をまとめて発注することで、データのやり取りの時間を短縮できるかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.575-2 - 2012/05/27 (日) 18:14:18 - xyz
読めた部分のインサート配列のところに、自分でプライマーを設計する。

インサートが長いプラスミドの全長をシークエンス解析するには? 削除/引用
No.575-1 - 2012/05/27 (日) 17:37:29 - 初心者
サブクローニングしたプラスミドを、ユニバーサルプライマー (SP6とT7) を用いて5'側と3'側から配列を読みました。しかし、インサートの配列が長くて、真ん中部分の配列が読めません。インサートの配列の全長をシークエンスで読みたい場合、どのような方法を用いればよいでしょうか? シーケンス解析は、企業の受託サービスを利用しています。

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