Bio Technical フォーラム

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augustusインストール トピック削除
No.5725-TOPIC - 2017/02/01 (水) 18:15:50 - fire
遺伝子予測のaugustusをインストールしようと思っています。
解凍してsrcに入ってmakeすると一部のaugustusやprepareAlignはコンパイルできるようですが、
filterBamやbam2hintsなどはできていません。
何かしないといけないのでしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.5725-2 - 2017/02/02 (木) 17:10:44 - seventh
READMEにも書いてありますが、bamtoolsとライブラリが必要です。
bamtoolsデフォルトのインストール場所の場合、augusutusのMakefileの変更も必要だったと思います。


http://www.vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/augustus.htm

augustusインストール 削除/引用
No.5725-1 - 2017/02/01 (水) 18:15:50 - fire
遺伝子予測のaugustusをインストールしようと思っています。
解凍してsrcに入ってmakeすると一部のaugustusやprepareAlignはコンパイルできるようですが、
filterBamやbam2hintsなどはできていません。
何かしないといけないのでしょうか？
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