全4件 ( 1 〜 4 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.5718-4 - 2017/01/30 (月) 20:30:27 - Hisa CDさん＞　ありがとうございます。　ソートしてからもう一度試してみることにします。 おおさん＞はい。検出限界が知りたいです

(無題) 削除/引用 No.5718-3 - 2017/01/30 (月) 12:14:36 - CD ＞ほぼ０％と出ました 古典的なバイサルファイトシーケンスをしたのだとしてですが、感度は拾ったクローン数によるのでは？ なのでBulkで0％だとしてもソート後の細胞群なら100％ということは有り得る。 とあるサブセットでのみ脱メチル化が起きているなら、各サブセットごとに分けて実験したほうがより説得力のあるデータになるように感じます。

(無題) 削除/引用 No.5718-2 - 2017/01/30 (月) 10:41:28 - おお 要するに検出限界が知りたいのですか？

Bisulphite sequencing 削除/引用 No.5718-1 - 2017/01/30 (月) 10:03:54 - Ox 平素よりお世話になっております。 培養後、ある細胞群の特定のDNA脱メチル化を調べるためにBisulphite sequencingをお願いしたところ、ほぼ０％と出ました。 その後、もし脱メチル化が起こっているとするならばその細胞群の中でも少数のsubset（約１〜２％）　だけなのではということに気づき、その細胞群をFACSでsortingしてからまたbisulphite sequencingに出そうと思うのですが、全体で０％と出ているのにこれは意味があることなのでしょうか？ Bisulphite sequencingにおいてPCR４０サイクルするのはわかっているのですが、それがどのくらいの感度なのかわかりません。 よろしくお願いします。

全4件 ( 1 〜 4 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---