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LC/MS/MSによるプロテオーム解析のプロトコール
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No.5680-TOPIC - 2017/01/17 (火) 13:45:33 -
TE
詳しい先輩方、どうかご教授ください。
あるタンパク質と相互作用するタンパク質を網羅的に解析しようと実験を行っております。あるタンパク質の抗体を用いて免疫沈降しました。このサンプルをSDS-PAGEで泳動してバンドのゲル切り出し精製した後、還元・アルキル化の工程は必要なのでしょうか。メルカプトエタノールにて還元しているので、必要ないのかと考えました。
周りに詳しいかたがいなくて、現在調べています。ご教授のほど、どうかよろしくお願い申し上げます。
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No.5680-5 - 2017/01/18 (水) 22:35:52 -
TE
> ABCさん
ご丁寧に教授していただき、ありがとうございました。
実験してみます。
(無題)
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No.5680-4 - 2017/01/17 (火) 19:27:41 - ABC
還元アルキル化は溶液中でもin gelでもどちらでもできますが、後者の方があまり頭使わなくていいし、方法が確立しており一般的です。泳動前にbetaMEで還元したsampleでも改めて還元アルキル化はして下さい。外部委託するならば、単に切出したゲル片を送れば還元アルキル化もやってくれるとおもいます。
(無題)
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No.5680-3 - 2017/01/17 (火) 16:20:04 -
TE
コメント頂きありがとうございます。
切り出し・精製後に改めて還元・アルキル化した方が良いということですか?
もう一つ質問です。
還元・メチル化する場合、泳動前にしたほうが良いのでしょうか。メルカプトエタノールだけでの還元では、泳動中にシステイン残基がプロピオンアミド化されると聞きました。
(無題)
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No.5680-2 - 2017/01/17 (火) 14:12:43 - Tokio
切り出し、精製している間に空気中の酸素で酸化されます。多分。
LC/MS/MSによるプロテオーム解析のプロトコール
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No.5680-1 - 2017/01/17 (火) 13:45:33 -
TE
詳しい先輩方、どうかご教授ください。
あるタンパク質と相互作用するタンパク質を網羅的に解析しようと実験を行っております。あるタンパク質の抗体を用いて免疫沈降しました。このサンプルをSDS-PAGEで泳動してバンドのゲル切り出し精製した後、還元・アルキル化の工程は必要なのでしょうか。メルカプトエタノールにて還元しているので、必要ないのかと考えました。
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